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标签主题：基因组组装

学术索引

BioTechniques：应对大数据的挑战

本文探讨了现代实验室中大数据带来的挑战，包括基因组测序和显微成像产生的海量数据。研究人员通过开发计算工具如khmer和Fiji插件来应对这些挑战，并强调了编程技能在数据分析中的重要性。文章还介绍了如何通过在线资源学习编程，以提升数据处理能力。...

2016-03-25 161 0

武汉植物园构建猕猴桃高密度遗传图谱助力分子辅助育种

武汉植物园团队利用RAD-seq技术构建猕猴桃高密度遗传连锁图谱，显著提升基因组组装质量，并定位性别相关区段，开发早期性别鉴定标记，为猕猴桃分子辅助育种提供重要工具，推动新品种培育和果树遗传研究。...

2015-10-09 100 0

海洋所首次完成仿刺参基因组测序和组装

中国科学院海洋研究所首次完成仿刺参基因组测序和组装，突破了复杂基因组技术瓶颈，获得高质量基因组数据。这一研究为刺参的繁殖发育、免疫调控、遗传解析等提供了重要理论支撑，并有助于推动刺参产业的健康可持续发展。...

2015-07-23 167 0

单分子测序改善微生物基因组组装

美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员在《Genome Biology》上发表文章，介绍单分子实时（SMRT）测序技术在微生物基因组组装中的应用。研究表明，利用单个PacBio RS测序文库，大部分已知细菌和古细菌基因组能被完整组装，成本低于1000美元。该技术有望改善微生物基因组数据库质量，推动群体规模泛基因组研究。...

2013-09-26 131 0

华大科技杂合基因组组装技术获重大突破

华大基因研究院宣布推出杂合基因组解决方案Ultra-Deep De novo，该方案基于高通量测序和SOAPdenovo2软件，通过超高深度测序和杂合序列识别算法，有效解决杂合基因组组装难题。目前已在林木、昆虫、海洋等多个物种中成功应用，标志着华大基因在基因组组装技术上的重大突破，将推动千种动植物基因组计划的进展。...

2013-03-15 241 0

《自然·生物技术》：首个家山羊高质量参考基因组发布

OpGen公司联合深圳华大基因研究院和中科院昆明动物研究所，利用ARGUS全基因组图谱系统结合NGS技术，成功生成首个家山羊高质量参考基因组，成果发表于《自然·生物技术》。该研究克服了NGS短读长局限，实现接近染色体水平的组装，为大型基因组从头组装设立新标准，对山羊育种和遗传研究具有重要意义。...

2012-12-28 180 0

第三代测序技术的希望与挑战

本文探讨了第三代测序技术（以PacBio RS为代表）的希望与挑战。该技术可实现单分子实时测序和长读取，有助于癌症、病原体检测等领域的研究。然而，高错误率、通量限制和成本问题阻碍了其广泛应用。研究人员开发了融合第二代和第三代测序的算法来校正错误，但软件和硬件仍需改进。预计第二代和第三代技术将长期共存，各自适用于不同的研究需求。...

2012-08-01 87 0

JGI科学家完成第一种甲壳类动物鸟枪法测序

联合基因组研究院完成了水蚤Daphnia pulex的首个甲壳类动物鸟枪法全基因组测序，获得包含12条染色体、约2亿碱基对的高质量序列数据。该测序采用随机片段化与计算机组装策略，确保序列准确性，数据公开后将促进环境遗传学及昆虫进化路径研究，揭示陆地生态系统演变的遗传基础。...

2006-01-25 532 0

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