糖科学的探索与挑战
时间:2017-08-16 15:34 来源:未知 作者:未知 点击:次
生命体中的糖分子扮演着至关重要的角色,尤其是在糖科学研究领域。人体内含有1000万至1亿种不同的糖蛋白,这些糖分子在细胞功能和生物过程中的重要性不容忽视。 碳水化合物作为一种复杂的分子,给研究带来了诸多挑战。然而,糖科学的研究者们并未放弃,他们正在开发新型的研究手段和工具,并积极推广这些新成果,以便更快地将其应用于实际。
尽管过量糖分摄入会导致健康问题,但糖生物学研究者却面临着获取足够糖分的难题。幸运的是,糖分子在哺乳动物细胞外广泛存在,形成了一层保护性的糖衣。美国斯坦福大学的化学及生物学家Carolyn Bertozzi认为,这层糖衣不仅仅是保护层,更是隐藏了许多重要信息的“森林”。 NIH国家医学研究所的生化学家Pamela Marino指出,细胞的糖衣如同生机勃勃的海洋,许多重要的生物学事件如细胞间的相互识别和信号传递都在此发生。糖不仅在能量代谢中发挥重要作用,还在细胞外部扮演着关键角色,例如O-GlcNAc在基因表达中的重要性。糖与发育、感染、炎症、肿瘤及神经退行性疾病等多方面密切相关。 Douglas Sheeley,NIH生物医学技术部门的负责人,表示我们已经掌握了大量关于聚糖分子结构多样性及其糖基化作用的资料。许多细胞蛋白质在表达和包装过程中需要糖基化修饰,这一过程决定了蛋白质的功能,因此成为研究的重点。 尽管糖分子研究手段已相对成熟,但仍未达到基因组学或蛋白质组学的高度。Sheeley指出,碳水化合物的研究难度在于其复杂的结合方式和分枝结构,这使得糖分子研究与DNA或RNA研究存在显著差异。 糖分子生物学研究的实验室通常使用生物化学实验、芯片技术和质谱技术等手段。然而,非糖分子专业实验室往往因学习曲线陡峭而退缩。Bertozzi和Verily生物科技公司的Krishnan Palaniappan认为,无论是专业人士还是非专业人士,都需要掌握这些技术,以获取完整的人体糖蛋白组资料。
哺乳动物细胞表面覆盖的糖分子森林,具有多样的结构和功能,等待着我们去探索。 艰难但有意义的工作 糖分子研究者们积极探索碳水化合物的生物医学角色。Marino提到,人体粘膜(如肺上皮组织)中含有结合糖分子的粘液素分子,这些糖分子在病毒感染中起着关键作用。例如,禽流感病毒的结合特异性改变后,可以感染人类。 病毒与细胞表面的糖分子结合,有些病毒甚至与多个糖分子结合,以增强结合的牢固性。许多病毒,包括HIV,利用糖分子包裹自身,以躲避免疫系统的识别和攻击。 目前,实验室能够合成基因和蛋白质,进行测序和改造,并构建海量数据库。然而,糖分子研究仍未达到这一高度,研究者们仍在不断努力。 多个NIH和美国国家科学基金会资助的项目涉及糖分子研究;美国国家标准及技术研究院设有碳水化合物部门;美国国防高等研究计划署也在开展糖科学研究项目。全球范围内,加拿大、欧洲、澳大利亚和日本等地也在进行糖科学研究。 许多科研团队与全球科研人员合作,推动了新兴技术的发展,包括碳水化合物合成和测序技术。Marino表示,这些技术具备自动化潜力,各实验室有不同的研究视角,研究方法多样。 多聚糖芯片作为一种高通量研究手段,有助于发现从蛋白质到微生物的聚糖结合方式。Marino提到,芯片技术是强大的研究手段,仍在不断发展中。加州大学圣地亚哥分校的课题组正在开发大规模唾液酸芯片,而埃默里大学的科研人员则在开发可标记多糖分子的多糖芯片。 Bertozzi等团队正在研究如何更方便地追踪O-GlcNAc糖基化修饰作用,以提高研究效率。她们希望新技术能帮助肿瘤分类和病理信号通路的研究,解决糖蛋白鉴定问题。
糖分子与蛋白质结合的特定位点,科研人员使用不同技术研究糖蛋白,以了解糖基化修饰的反应。 质谱检测技术 Bertozzi和Palaniappan指出,鉴定蛋白质与糖结合的技术往往需要人工操作。核磁共振波谱法、液相色谱和电泳技术可用于鉴定多糖与蛋白质的结合,但由于样品复杂性,实际应用中存在困难。液相色谱与质谱联用是一个较好的替代方案,能够帮助科研人员分离多糖分子,供后续质谱分析。 化学实验手段有助于解决糖基化修饰的复杂性和异质性问题。糖蛋白是一种低丰度且成分复杂的混合体,研究人员难以获得足够量的样品进行实验分析。蛋白质的同一位点可以结合多种糖分子,而每个单糖分子又可以以不同方式结合。 在质谱实验中发现,糖分子可能抑制离子化。Bertozzi设计了新的标记技术,以提高糖蛋白片段的识别率。科研人员使用非天然糖分子同系物进行标记,同时结合二溴化物标记,以便让更多科研人员使用这种技术。 Thermo Fisher科技公司的化学家Julian Saba指出,质谱技术在蛋白质和多肽研究中常见,但在糖分子研究中应用不广。糖分子与蛋白质结合后,质谱仪难以解析其结构,解离糖分子后则容易得多。因此,需建立专门的样品制备流程和数据分析软件。 Saba强调,酶可帮助释放多糖分子,但也会影响研究流程。使用PNGase F等酶解离糖分子时,可能导致质量漂移,影响结果。因此,建议不去掉糖蛋白上的糖分子,以保留重要信息。 Saba还指出,糖分子研究的复杂性使得质谱技术的应用范围有限。糖分子结合的方式多样,研究人员需同时了解蛋白质和糖分子的信息。
质谱技术在糖分子研究中尚未普遍应用。上图展示了从免疫球蛋白G分子分离的糖分子的质谱分析结果,科研人员可根据峰图识别每个片段。 糖组学计划 英国牛津大学的Raymond Dwek在上世纪八十年代提出了“糖生物学”概念。随着组学概念的出现,糖组学逐渐形成。Cummings等科研人员发现,家用漂白剂可使组织中的糖分子解离,促进糖组学的发展,帮助科研人员了解糖分子的多样性。 Cummings还提出“抗糖组学”概念,涉及所有与病原体碳水化合物发生免疫反应的分子。糖科学研究正迎来新的发展阶段,制药公司也越来越关注糖科学,以确保其生产的单抗类药物具有稳定的糖基化修饰。 Lauc指出,制药公司希望控制糖基化修饰,以避免产品间的质量差异。糖基化反应的变化可能影响蛋白质的半衰期和免疫原性,因此利用糖基化修饰机制改造蛋白质成为研究热点。 Lauc的团队正在研究与免疫球蛋白G糖基化相关的糖组学问题,分析3万人的糖基化数据,并计划扩大到10万人。研究将结合表型、遗传和生物化学数据,以探讨不同生活方式和生理条件对糖组学的影响。 Lauc团队还结合化学与生物信息学技术,开展高通量糖科学分析工作,强调样品质量的重要性。通过统计学方法、质谱技术和荧光标记液相色谱等手段,Lauc团队致力于提高研究的稳定性和准确性。 糖组学为基因组学提供了额外的信息,Lauc的研究将探讨糖基化修饰对表观遗传学的影响。数据整合和分享的挑战仍然存在,糖科学界需建立大型公共数据库以促进研究。 数据利用 美国乔治华盛顿大学的生物信息学家Raja Mazumder认为,糖科学数据应为更多人所理解,而非仅限于数据生产者。Mazumder与William York共同搭建糖科学分析软件的网络共享社区,以促进数据的广泛应用。 各实验室对肿瘤细胞糖基化修饰情况的研究类似于肿瘤基因组学研究,但现有数据库的复杂性使得科研人员难以找到有用信息。Mazumder强调,整合计算资源与基因组数据是理解糖分子生物学意义的关键。 NEB公司的糖科学家Paula Magnelli指出,开发生物疗法和重组糖蛋白是研究糖分子和糖蛋白的根本驱动力。NEB公司致力于提供糖科学研究所需的工具酶,以支持科研人员的研究工作。 Magnelli强调,糖科学研究需要标准化的试剂盒,以便提供丰富的糖分子结构信息。NEB公司正在开发符合实验流程需求的工具酶,以促进糖科学的研究进展。 (责任编辑:泉水) |



