转录组学与测序技术 斑马鱼单细胞转录组学研究进展:从发育图谱到疾病模型
一 斑马鱼作为单细胞转录组学研究的理想模型 斑马鱼 Danio rerio 作为一种经典的脊椎动物模型生物 在单细胞转录组学时代展现出独特的优势 与哺乳动物模型相比 斑马鱼具有以下显著特点 1. 胚胎 关键词:疾病、稳态...
一 斑马鱼作为单细胞转录组学研究的理想模型 斑马鱼 Danio rerio 作为一种经典的脊椎动物模型生物 在单细胞转录组学时代展现出独特的优势 与哺乳动物模型相比 斑马鱼具有以下显著特点 1. 胚胎 关键词:疾病、稳态...
非洲爪蟾 Xenopus laevis 作为经典的两栖动物模式生物 在过去一百多年里为理解脊椎动物发育和疾病做出了重要贡献 从进化角度看 两栖动物是连接哺乳动物与更古老脊椎动物的关键过渡类群 关键词:转录组、红细胞...
一篇发表于 Frontiers in Bioinformatics 的迷你综述系统性地概述了单细胞RNA测序数据库的现状 分类 使用场景及局限性 文章指出 自2014年首个商业化单细胞平台问世以来 s 关键词:转录组、阿尔茨海默病...
文章亮点 系统性综述 从数据科学视角 全面总结了深度学习在单细胞RNA测序和空间转录组学数据分析中的最新进展与核心挑战 大规模基准评估 整合了来自9个基准数据集的21个数据集 对58种计算方法进行了性 关键词:神经网络...
一项发表于 免疫学前沿 的研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 利用机器学习算法识别出与胶质母细胞瘤 GBM 中乳酰化 lactylation 水平升高相关的三个核心基因 SSBP1 RPA 关键词:生物标志物、翻译...
本研究提出了一种创新性的计算框架,通过整合转录组数据与大脑表面影像表型,成功解码了神经影像学特征的分子基础。研究团队利用基因表达数据构建了影像表型与基因表达之间的映射模型,并将其应用于药理基因组学分析。该方法不仅揭示了特定脑区结构差异的遗传调控机制,还为预测药物反应及筛选潜在治疗靶点提供了全新的生物信息学工具,展现了多组学整合在神经科学领域的巨大潜力。...
本研究通过整合单细胞转录组学与神经回路连接组学,深入解析了成人大脑神经发生的时空演变规律。研究发现,成人大脑中神经回路的形成与特定的基因表达谱高度相关,揭示了神经元从前体细胞向成熟功能性神经元分化的分子机制。这一发现不仅阐明了成人神经发生的复杂调控网络,也为理解大脑可塑性及神经退行性疾病的修复机制提供了重要的理论依据。...
本研究通过整合人类血液样本的表观遗传学与转录组学数据,系统性地识别了与衰老过程密切相关的关键基因。研究团队利用多组学分析方法,揭示了DNA甲基化与基因表达在衰老调控中的协同作用,为理解衰老的分子机制及开发潜在的抗衰老生物标志物提供了重要理论依据。该成果不仅阐明了血液衰老的复杂调控网络,也为临床评估生物学年龄提供了新的分子视角。...
本研究利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)与空间转录组技术,深入解析了蜕皮激素(20E)在家蚕翅原基发育过程中的调控网络。研究发现,20E通过诱导特定细胞群的转录重编程,精确调控翅原基的细胞增殖与分化。通过构建高分辨率的空间图谱,研究揭示了激素信号在组织微环境中的梯度分布及其对形态发生的空间特异性影响,为理解昆虫变态发育的分子机制提供了重要理论依据。...
空间转录组学技术虽能提供组织的空间分布信息,但受限于捕获点大小,往往难以达到单细胞分辨率。CellRefiner 算法通过整合单细胞 RNA 测序数据与空间转录组数据,利用深度学习模型对基因表达进行去卷积和空间映射,成功实现了组织切片中单细胞水平的基因表达重构,为深入解析复杂组织微环境及细胞间相互作用提供了高精度的计算解决方案。...
非洲爪蟾 Xenopus laevis 作为经典的两栖动物模式生...
12月10日著名学术期刊美国 国家科学院院刊 Proc...
先后就读于厦门大学和华西医科大学的陈炜于2...
英国一项最新研究说 基因测序技术的进步已经使...