来自美国翻译基因组研究院(TGen)和Scottsdale健康中心弗吉尼亚G. Piper中心的研究人员,近期完成了对一种罕见鼻腔癌——对称嗅神经母细胞瘤(ONB)的全基因组测序。他们分析了构成患者正常DNA和癌性DNA的数十亿个分子,发现了未来可作为精准医疗药物开发靶点的基因变异。该研究结果在线发表于《PLoS One》杂志。
“对于晚期癌症患者,尤其是罕见癌症病例,医生在制定治疗计划时选择有限,”文章的主要作者、弗吉尼亚G. Piper癌症中心胸腔科主任、TGen癌症和细胞生物学部副教授Glen Weiss博士说。“目前还没有综合的基因组测序研究来鉴别这些罕见嗅神经母细胞瘤的突变图谱,以确定患者的治疗靶点。”个体化医疗包括针对特定遗传靶点的精确药物,以缩小甚至消除肿瘤,同时避免常规化疗的破坏性毒副作用。
研究对象是一名29岁的年轻男性,他在弗吉尼亚G. Piper癌症中心接受了数年的标准治疗,包括放疗和常规化疗。但他的转移性嗅神经母细胞瘤持续突变并复发,导致畸变性损害和广泛的手术重塑。TGen研究人员对该患者的活检肿瘤和血液进行了分析,读取了肿瘤DNA和正常DNA中数十亿个分子碱基。通过比对,他们鉴别出几个重要的基因突变,包括:MAP4K2、SIN3B、TAOK2、KDR、TP53、MYC和NLRC4。这些基因是基于临床关联性和先前关于靶基因与癌发生相关性的文献而选出的。
资深作者、TGen综合癌症基因组学部主任及教授、研究副主任John Carpten说:“这些突变靶基因涉及DNA修复机制和凋亡的失常。这项研究提供了对这种罕见而可怕的癌症类型基础的新认识。我们希望将这些研究结果转化为改善罕见癌症临床治疗的工具。”文章还指出,需要进一步研究来解析嗅神经母细胞瘤癌症突变和进展的机制,以及全基因组测序如何在未来分析中发挥重要作用。
“随着成本的降低、分析速度的提高和对复杂遗传改变的全面了解,我们预计全基因组测序将在临床中更频繁地应用于常见和罕见癌症,并为个体化医疗铺平道路,”文章的另一位资深作者、TGen神经病基因组学部副主任和副教授David Craig博士说。国家癌症研究基金会会长Franklin C. Salisbury Jr.表示:“这项研究代表了癌症研究的一个里程碑,通过基于基因组学的个体化医疗更好地治疗甚至治愈癌症。全基因组测序让科学家们对许多癌症的遗传基础获得了更好的理解。基于测序揭示的突变,医生将能够鉴别出设计靶向这些突变的现有抗癌药物或新抗癌药物。这是一种治疗性的研究。”
(生物通:何嫱)