
一项最新发现的遗传时钟作为机体发育的“计时器”,精确协调着生长所需的基因活动爆发。研究人员发现,当这个时钟出现故障时,发育进程便会停滞不前。
想象一列停靠在车站的火车:乘客已登车,列车员正在检票,一切准备就绪。然而,如果工程师的怀表从未发出发车信号,车门将始终敞开,汽笛永不鸣响,火车也永远无法驶离站台。
类似的“时序错误”也会发生在活体生物内部,当发育时序出现问题时,机体内部的日程安排紊乱,可能导致正常的生长和成熟无法进行。
冷泉港实验室(CSHL)的研究人员现已在微小的秀丽隐杆线虫(C. elegans)中识别出一种似乎是“主发育时钟”的机制。这一发现有助于解释细胞在生长和发育过程中,如何精确地知道何时激活关键的遗传程序。
CSHL教授Christopher Hammell及其同事此前的研究表明,秀丽隐杆线虫的发育是由基因活动的爆发或脉冲驱动的。然而,这些脉冲如何能如此精确地计时,此前一直是个未解之谜。
这项新研究揭示,两种已知的蛋白质——MYRF-1和LIN-42——共同形成了一个反馈回路,充当着核心的发育时钟。它们协同决定了每个基因表达脉冲何时开始以及持续多长时间。
研究人员指出,这是首次发现一种生物时钟的设计目的在于运行一系列有限的事件序列,而非连续重复。Hammell解释说:“这是线虫所有细胞的中央时钟。它负责协调一系列有限的、顺序发生的基因表达脉冲,这些脉冲必须只发生一次,并按顺序进行,才能确保正常的发育进程。它就像一个棘轮,在发育过程中多次开启和关闭基因,但最终,它只朝着一个方向前进。”
为了揭示该系统的工作原理,研究团队结合了传统的分子生物学实验、DNA测序、蛋白质测序以及人工智能工具AlphaFold。
他们的研究结果表明,MYRF-1在发育过程中发挥着多项关键作用。这种蛋白质不仅有助于启动每一波新的基因活动,也是标记每个发育阶段结束的检查点所必需的。
一旦基因表达脉冲开始,MYRF-1便会激活LIN-42。随后,LIN-42调节脉冲的强度以及其持续时间。
当研究人员阻断MYRF-1的功能时,整个发育过程便会崩溃,这充分证明了该蛋白质对于维持正常生长轨迹的不可或缺性。
Hammell表示:“我们以前从未见过这样的机制。MYRF-1是所有细胞主调控时钟的一部分,但它也充当着每个生长阶段的‘钥匙制造者’和‘主钥匙’。如果没有每个阶段正确的‘钥匙’,发育就会停滞不前。”
研究团队还包括CSHL研究主任Leemor Joshua-Tor。目前,科学家们正在进一步研究MYRF-1和LIN-42如何进行物理相互作用,以及在发育过程中独立的细胞时钟是否会相互通信。
理解这些计时系统如何保持协调,将为细胞生长、分化和发育进程提供重要的见解。
Hammell指出:“MYRF-1/LIN-42回路在所有细胞中运行。当你观察正常发育时,每个独立的细胞时钟似乎都保持同步。但它们之间是否相互通信?我们以前从未深入思考过这个问题。”
回答这个问题最终可能有助于科学家更好地理解发育障碍和遗传疾病。通过揭示机体发育时钟如何保持同步,这项工作可能为这些系统出现故障时所发生的情况提供新的线索。
正如火车没有正确的信号就无法离站一样,健康的发育也依赖于精确的时序。研究人员现在相信,他们已经识别出维持这一过程向前推进的关键机制之一。