描述
本文介绍了一种检测HOXB3基因TaqI多态性的方法。
实验步骤
使用TaqI酶切HOXB3基因的PCR扩增产物。模板:100-200 ng基因组DNA,反应体积25 μl。引物1(H2GCK3):5'-TAT TTT TGT GAT CAA TGG AGA CC-3',100 ng/反应;引物2(H2GCK3R):5'-ACA GAG TCC CTC ACT GCT G-3',100 ng/反应。dNTPs:终浓度200 μM。缓冲液:终浓度2.25 mM MgCl2,50 mM KCl,10 mM Tris-HCl pH 8.4。Taq DNA聚合酶:0.5 U/25 μl反应体积(Perkin-Elmer Amplitaq DNA聚合酶5 U/μl,货号N808-0145)。PCR循环条件:94°C 5分钟;94°C 30秒,60°C 30秒,72°C 1分钟,共30个循环。产物大小:TaqI酶切后,316 bp片段可被切分为200 bp和116 bp两个片段(+/+个体)。
参考文献:Ogura, T., C.M. Castiglione, A.J. Pakstis, and K.K. Kidd, 1991. Two RFLPs at the HOX2G locus. Nucleic Acids Research 19:1716.