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酵母穿梭诱变/表位标记实验方案

2005-07-18 00:00 未知 未知 阅读 0
核心摘要: 本文详细描述了使用mTn-lacZ/LEU2对酵母基因进行穿梭诱变和表位标记的实验方案,包括载体构建、细菌接合转移、共整合体解离、DNA拯救、酵母转化及lacZ融合子筛选等步骤。该方案适用于酵母功能基因组学研究,通过转座子插入实现基因的随机突变和标记。

描述

本方案详细描述了使用mTn-lacZ/LEU2对酵母基因进行穿梭诱变和表位标记的完整流程。穿梭诱变是一种高效的基因操作技术,通过转座子插入实现基因的随机突变和标记,适用于功能基因组学研究。

步骤

1. 穿梭诱变

将目标基因片段克隆至载体pHSS6(来自菌株R1123,图谱见下文)。尽可能删除多克隆位点,以避免转座子“热点”插入。转化至LB Kan40平板筛选。

将质粒转化至感受态细胞R1236/B211,在LB Kan40 Cm34平板上筛选。

通过与菌株B198接合转移F::mTn-lacZ/LEU2:将供体菌B198(含Amp50抗性)和受体菌B211分别过夜培养,次日1:100稀释至新鲜无抗培养基,37℃培养至早期对数期(可见细胞旋涡)。取200 μl各菌液混合,37℃静置20分钟至1小时,涂布100 μl至LB Amp50 Kan40 Cm34平板,30℃培养1-2天,获得共整合体。

2. 共整合体解离

将菌株R1230在Sm50中过夜培养。从平板上洗脱菌落:加入2 ml LB,用涂布器刮下菌落,获得洗脱液(应含数千菌落)。将R1230过夜培养物1:100稀释(无抗),洗脱液调至相近密度。混合后接合20分钟至1小时,涂布100 μl至LB Amp50 Kan40 Sm50平板,37℃过夜。对照:将起始菌株点种于该培养基。

3. 从解离菌株中拯救DNA

用LB洗脱菌落(应达数千),取部分洗脱液稀释至接近饱和密度,加Amp50和Kan40,37℃培养数小时。用碱裂解法小量制备DNA:使用150 μl 7.5M NH4Ac作为溶液III,270 μl异丙醇沉淀,可去除大部分蛋白质和RNA,获得干净的小沉淀。注意全程冰上操作以防核酸酶降解。

取约1/10小提产物转化至常规recA endA克隆菌株(如DH5α),涂布LB Amp50 Kan40平板。

4. 转化酵母并筛选LEU2

将全部转化子洗脱(目标数千个),再次小提制备DNA(可保存-70℃备用)。用NotI消化整个库的DNA,转化酵母,筛选lacZ融合子。

5. 酵母中筛选框内lacZ融合

将转化子点种至SC-leu平板。用Whatman 1A滤纸复制至SC-leu平板和含滤纸的SC-leu平板,30℃过夜。对于ade2菌株,培养基需含80 mg/l腺嘌呤,以免红色色素干扰X-gal结果。

将滤纸转移至9 cm玻璃培养皿盖中,置于含氯仿的15 cm玻璃培养皿内,熏蒸10-30分钟(具体时间需经验确定)。

将滤纸菌落面朝上置于X-Gal平板(120 μg/ml X-gal, 0.1 M NaPO4 pH7, 1 mM MgSO4, 1.6%琼脂),30℃孵育至2天。阳性融合子可从原始SC-leu平板回收,后续尽量维持LEU2选择压力,因为某些突变即使在杂合状态下也有害。

配方

(原文未提供具体配方,建议参考标准分子生物学手册)

材料

(原文未列出)

提示

(原文未提供)

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