描述
DRD2 TaqI "D" 多态性是指位于多巴胺受体D2基因(DRD2)上的一个限制性片段长度多态性(RFLP)位点,由限制性内切酶TaqI识别。该多态性位于第2外显子下游约3.5 kb处,与多种神经精神疾病(如精神分裂症、成瘾行为)的遗传关联研究密切相关。
实验步骤
模板:基因组DNA,每25 μl反应体系使用100-200 ng。
引物:
- 引物1(TaqDck4):5' CCT CTG AGG CTT ACT GTC TG 3',每反应100 ng。
- 引物2(D2Ex2UP7):5' AAA ACT AGG GAG GGT CAG AG 3',每反应100 ng。
dNTPs:终浓度各200 μM。
缓冲液:终浓度1.5 mM MgCl2,50 mM KCl,10 mM Tris-HCl(pH 8.4)。
Taq DNA聚合酶:每25 μl反应体系0.5单位(推荐使用Perkin-Elmer Amplitaq DNA聚合酶,5 U/μl,货号N808-0145)。
PCR循环程序:94°C预变性5分钟;然后94°C变性30秒,60°C退火30秒,72°C延伸1.0分钟,共30个循环;最后72°C延伸5分钟。
注意:这两条引物可识别相距仅160 bp的两个多态性位点;如需区分,可将PCR产物分为两份,分别用两种限制酶进行酶切。
产物大小
TaqI酶切后:300 bp片段被切割为212 bp和88 bp(若存在酶切位点纯合子)。
参考文献
Kidd, K.K., B. Morar, C.M. Castiglione, H. Zhao, A.J. Pakstis, W.C. Speed, B. Bonne-Tamir, R.-B. Lu, D. Goldman, C. Lee, Y.S. Nam, D.K. Grandy, T. Jenkins, and J.R. Kidd, 1998. A global survey of haplotype frequencies and linkage disequilibrium at the DRD2 locus. Human Genetics 103:211-227.