当前农业发展进程中一个带战略性的问题是动植物种质资源保护问题。这是因为我们赖以生存的种质资源的丧失日趋严重。不仅野生的动植物品种在不断地消亡，而且过去栽培或养殖的地方品种也在不断地减少。有些地方野生鱼类品种至少消亡了十几种，有些珍贵陆地野生动物也不见踪影；真正的土鸡土猪只有在偏僻的山区才能找到，有些地方的土鸡土猪和地方牛羊品种已被外地品种乱交变成了“混血儿”，不是真正意义上的纯种。血橙（夏橙）等地方珍稀植物品种只能找到孤株，濒临灭绝……。地方种质资源逐渐丧失的症结在哪里？

　　认识上的偏颇。外来品种一般具有投产周期短、生长快、产量高等特点，有些品质也有其突出优点（如瘦肉型猪），引进扩种是必要的，因为它有利于改善品种结构和生产结构，而且今后还要加强这方面的工作。但在扩种的同时，有些地方把外来品种和本地品种完全对立起来，认为“不是甲存、就是乙亡”，放肆排挤地方品种，意欲赶尽杀绝而后快。如以政府干预的方式，大量宰杀地方母猪，不准饲养地方品种的公猪等。在有些地方，地方牛羊鸡禽品种、水果品种、经济作物品种也遭到同样的厄运。实际上地方品种过去之所以在当地有一定的种养规模，它们也有其突出的优点。如土鸡肉的松软适口等。保护多样化的地方种质资源是构成农产品的多样化、满足市场多样化需求的重要前提和条件。这不，现在土鸡又得到了市场的广泛认同，价格比“洋鸡”品种高出一倍左右。正当有些地方土鸡开始形成支柱产业时，一些灭绝土鸡“成效”显著的地方又有何感触呢？能简单地归结于“三十年河东、四十年河西”的轮回吗？

　　放任品种间的乱交。这在放养（牧）的动物中尤为严重。由于没有建立特种地方动物保种区，以致于外地品种（引进）与本地品种，本地不同品种之间无目的“通婚”乱交现象普遍。在有这种现象的地方，鸡是“半边子”，鸭是“大杂烩”、牛是“混血儿”……，不伦不类。由于基因重组，地方品种纯正的种质基因变成多品种基因的“杂合体”，具有特色的地方种质基因也就丧失殆尽。另外，一些珍稀地方植物品种由于没有适当隔离而出现不同品种的串粉而退化，或因没有提纯复壮而丧失了品种的优良特性。

　　对野生动植物资源利用采取“杀鸡取卵”的方式。如对野生鱼类的过度捕捞和乱捕滥捞，目前最为严重的问题是各种用电麻鱼的行为屡禁不止；对野生青蛙、虎纹蛙、岩蛙、蛇等野生动物的捕杀达到了不可复加的地步；对野生植物的乱采乱挖，以致于资源濒临枯竭，进而危及到种质资源的存在，这在甘草、鱼腥草等野生药材植物上尤为突出。一些珍稀的树种资源满足不了人类的强烈欲望，也有“取之有竭”的危险。

　　环境污染仍然危及有些物种的生存。如江河野生鱼类种质资源的减少和灭绝在较大程度上与农药、化肥等对水域的污染有关，污染带来的影响还在继续恶化。

　　要重视和切实保护好地方种质资源。丰富的种质资源是农业发展的重要源泉和前提条件。动植物育种和杂交利用实际上是对种质资源的利用与开发。如水稻杂交优势广泛利用最先是以利用野生稻中野败不育株为突破口的。难以想象如果没有野生稻不育种质资源，当时杂交稻的应用推广又是怎样一种情况！生物种质资源的多样化是生物多样化的核心所在，而生物的多样化是人类赖以生存的重要条件之一。这不仅是食物多样化的需要，而且是保护人类生存环境的需要。在某种意义上讲，保护种质资源（包括地方种质资源）就是保护我们的生命线。因此要针对地方种质资源保护上存在的问题，采取积极有效的对策予以保护，防止和减少地方种质资源的丧失，并使之成为社会全体成员的自觉行动。