2006年11月8日，北京蛋白质组研究中心与美国AB公司在北京宣布正式成立“蛋白质组合作实验室”。这一合作旨在充分利用双方在现代科学理念、技术与人才方面的领导优势，共同致力于蛋白质组学前瞻性领域的基础研究与技术创新。

该合作实验室将配置美国AB公司最新的4800 MALDI TOFTOF™串联飞行质谱仪系统和iTRAQ™蛋白定量标记试剂，并结合已有的4700 MALDI TOFTOF™串联飞行质谱仪系统。这将进一步提升北京蛋白质组研究中心的科研仪器和平台建设水平，为巩固其科研成果的国际领先地位提供有力的支持。

北京蛋白质组研究中心是在科技部和北京市的支持下，由军事医学科学院、中国科学院、中国医学科学院、清华大学、北京大学、江中集团以及北京新医药和生物技术发展促进中心等单位共同发起组建的国家级蛋白质组研究机构。中心已建立蛋白质表达谱、蛋白质修饰谱、蛋白质相互作用等高通量的技术平台。

美国AB公司为生命科学家提供基因研究、蛋白质研究和新药开发所需要的第一流的仪器平台、消耗品及软件系统，并对客户提供完善的技术支持和服务。