部分青年科学家指出，我国在作物分子育种领域与发达国家的主要差距在于，不能有效地发掘和利用种质资源中的有利基因；缺乏有自主知识产权及育种价值的基因和标记；对控制重要性状的基因、基因间及其与环境互作的分子基础知之较少；多种遗传改良信息和技术的集成应用不足，缺乏系统的品种设计思路。

全国23家科研院所和大学的62名青年科学家，近日在北京召开的“青年科学家论坛”上呼吁，集成不同学科领域的最新研究成果，深入研究作物种质基因发掘理论和重要性状形成的分子基础，以提高作物分子育种理论和技术的创新能力和国际竞争力。

青年科学家认为，以基因改良为主要目标的作物分子育种技术，在提高选择效率、改善品质、增强品种抗逆性方面可发挥重要作用，是实现作物育种突破的关键。而我国在这一领域的研究起步较晚，研究单位在人员、材料、信息等方面的交流与沟通不够，在一定程度上限制了它的快速发展。

作物分子育种专家、中国农业科学院作物所所长万建民教授指出，美国、澳大利亚、英国、日本等发达国家在实施了水稻、玉米等主要作物基因组测序的基础上，已相继启动了大豆、小麦、玉米等分子育种计划；国际水稻所与国际玉米小麦改良中心也启动了水稻、玉米、小麦分子育种计划，重点开展新基因发掘、种质创新和分子育种的理论和技术研究，并在部分常规育种无法解决的问题上展现出明显的优越性。在“十五”“863”计划中，我国也设置了重大专项，构建水稻、小麦、玉米、大豆等作物的基因开发、分子育种技术。在新品种培育方面取得了重要进展。

青年科学家呼吁，今后应以我国丰富的作物基因资源为核心，以学科交叉为手段，立足于国家粮食安全与农业可持续发展的重大需求，集中设施、人才和资金优势，重点开展农作物重要基因的发掘与鉴定、重要性状形成的分子基础、作物品种设计的理论和方法研究，促进分子育种与常规育种技术的有机结合，构筑作物分子育种技术体系，寻求作物育种理论的重大科学突破。