IBM与乔治亚理工学院近日宣布，世界上最强大的超级计算集群之一将落户乔治亚理工学院新建的系统生物学研究中心。该中心将利用IBM的高性能计算技术，推动针对癌症等重大疾病的新药研发，旨在显著缩短药物从实验室到市场的时间。
该研究中心由美国乔治亚州、乔治亚研究联盟及美国国家健康协会共同出资850万美元成立，由世界领先的系统生物学家Jeffrey Skolnick博士领导。Skolnick博士曾因在计算系统生物学领域的杰出贡献获得乔治亚研究联盟杰出学者奖。研究中心将Skolnick博士的生物医学专业知识与IBM的高性能计算能力相结合，开发出一台全新的超级计算机。该集群基于Linux系统，是全球运行速度最快的超级计算集群之一，也是美国东南部研究型大学中最强大的计算集群。集群将由BellSouth公司在亚特兰大市中心的世界级设施托管运行。
Skolnick博士表示：“通过使用IBM技术，我们可以显著缩短新药上市时间。系统生物学融合了数学、物理、化学、生物学以及先进的高性能计算和工程设计。生物信息学和系统生物学使我们能够充分利用人类基因组序列提供的大量信息，将药物开发中需要筛选的化合物数量减少十倍。”
该集群由1000个节点组成，采用IBM BladeCenter刀片系统，配备双核AMD Opteron处理器，每秒可完成超过8.5万亿次计算。按2005年11月的TOP500排名，其性能可位列世界第41位。系统的性能和可扩展性将使学生和研究人员能够快速准确地分析复杂的DNA和蛋白质，揭示与癌症相关的生物学和化学过程，从而开发更具针对性的治疗药物。
IBM BladeCenter刀片服务器副总裁Doug Balog指出：“大学正在寻求最快、最具创新性和性价比最高的系统，以将研究成果转化为商业产品。基于AMD Opteron LS20 BladeCenter的Cluster 1350系统，为乔治亚理工学院提供了足够的处理能力和资源，帮助研究人员做出更准确的决策，并提升学院在全国顶尖研究机构中的地位。”
乔治亚研究联盟主席兼首席执行官Mike Cassidy表示：“只有掌握最先进技术的大学才能在药物发现和生物信息学领域保持竞争力。乔治亚理工学院对顶级技术和研究设施的投入，以及Jeff Skolnick博士等世界级学者的吸引力，将提升学院在竞争性市场中的表现，吸引美国最优秀的学生加入，共同推动药物开发，改善人类健康。”
BellSouth为支持这一高能耗密度的超级计算集群设计了独特的主机托管环境。BellSouth首席技术官Bill Smith表示：“凭借我们在主机托管领域的经验，我们能够快速创建支持乔治亚理工学院和IBM的解决方案，为Skolnick博士的创新研究提供支持。”
新超级计算机的峰值性能超过每秒16万亿次浮点运算（16 TeraFlops），由1000个采用AMD Opteron处理器的LS20刀片服务器节点组成。基础架构节点运行Red Hat Linux 4操作系统，计算节点运行Scientific Linux。这种结构构成了IBM Cluster 1350，一个可预先安装和测试、超高密度且易于管理的超级集群。
AMD全球商业业务部副总裁Kevin Knox表示：“AMD64技术提供了超级计算机所需的处理能力，同时不牺牲每瓦特的性能效率。通过与IBM在基于AMD Opteron的BladeCenter集群上的合作，乔治亚理工学院的研究人员将获得更好的设备，在苛刻的时间限制下完成工作，更快地将重要药物和研究成果推向市场。”
此外，IBM还提供了28TB的DS4800存储系统和20TB的DS4100存储系统，用于存储大量研究数据并提供灾难恢复备份能力。BladeCenter中集成了Force10 TeraScale E系列交换机/路由器，提供弹性互连，支持可预测的集群性能和可扩展性，使乔治亚理工学院能够无缝扩展集群。
Force10 Networks总裁兼首席执行官Marc Randall表示：“网络弹性是确保计算过程不中断、研究人员获得可靠计算能力以高效分析大量数据的关键。IBM领先的服务器技术与我们的交换机/路由器相结合，实现了单一的高性能集群解决方案，为系统生物学研究中心等机构提供了先进科学研究所需要的计算能力。”
该解决方案还包括IBM的“酷蓝”（Cool Blue）散热系统（IBM Rear Door Heat eXchanger），利用现有冷却水源支持数据中心空调系统，最多可将服务器排放到室内的热量减少55%。乔治亚理工学院已在12个机架上安装“酷蓝”，降低了噪音和空调系统负荷。这种散热系统最多可将首次安装成本降低40%，同时降低近15%的能源成本。
新的集群解决方案提高了研究中心数据中心的总体性能，同时降低了总拥有成本。系统的速度和灵活性缩短了研究项目完成时间，使研究中心能够有更多时间拓展药物科学和医疗领域的商业机会。