一项发表于《通讯生物学》的研究对碳青霉烯耐药霍氏肠杆菌（CR-Eh）进行了全球基因组和分子流行病学分析。碳青霉烯耐药肠杆菌已被世界卫生组织列为关键优先病原体，而霍氏肠杆菌作为阴沟肠杆菌复合体中最主要的物种之一，其耐药性的全球传播对公共卫生构成严重威胁。本研究通过大规模基因组分析，揭示了CR-Eh的全球流行病学特征和分子传播机制。
研究对3株临床CR-Eh分离株进行了表征，并结合全球基因组数据集，发现了耐药基因携带的不同模式。值得注意的是，blaNDM-1在BC18菌株的染色体上呈双份存在，但在其他分离株中位于质粒上；而mcr-9则在一个保守的遗传背景下在IncHI2质粒上被检测到。对来自47个国家的公开基因组的分析表明，blaNDM变体（主要是blaNDM-1和blaNDM-5）和mcr-9在全球广泛分布。在现有数据集中，分离株表现出高度的遗传多样性，涉及众多序列类型（包括高风险克隆ST171和ST190）和质粒（IncX3/IncHI2）参与其传播。这些菌株平均携带14个抗生素耐药基因（ARGs），系统发育分析提示可能存在跨境和跨栖息地的传播。
研究结果强调，霍氏肠杆菌不仅仅是一种病原体，更是一个高度适应的ARG积累和传播的遗传库，突显了进行系统性“One Health”基因组监测的迫切需求。该研究通过整合全球47个国家的公开基因组数据以及新测序的3株临床分离株，揭示了碳青霉烯耐药霍氏肠杆菌（CR-Eh）的全球分子流行病学特征。研究发现blaNDM（主要为NDM-1和NDM-5）和mcr-9基因在全球广泛分布，且主要位于IncX3和IncHI2型质粒上。菌株呈现高遗传多样性，并存在高风险克隆（如ST171、ST190）的跨地域传播。研究团队来自中国科学院大学杭州高等研究院等机构。
参考文献
Long, X., Tang, B. et al. (2026). Global genomic and molecular epidemiology of carbapenem-resistant Enterobacter hormaechei. Communications Biology. DOI: 10.1038/s42003-026-09895-2