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英国将测序万人基因组用于疾病研究

2010-07-05 16:48 未知 未知 阅读 0
核心摘要: 英国维康基金会宣布启动UK10K项目,计划在三年内对10000人进行基因组测序,旨在发现与肥胖、精神分裂症等疾病相关的罕见基因变异。项目包括4000人的全基因组测序和6000人的外显子测序,重点关注极端肥胖、神经发育障碍和先天性心脏病等表型。该计划将借鉴国际千人基因组计划的经验,推动疾病基因研究。

近日,在英国伦敦的科学博物馆,维康基金会(Wellcome Trust)宣布了英国10K(UK10K)项目,即英国将在接下来的三年内测定10000个人的基因组序列。英国10K项目的负责人Richard Durbin表示,这项宏伟的计划将得到生物医学慈善会约1000万英镑的支持,10K项目旨在找出与肥胖和精神分裂症等疾病相关的罕见基因变异。

研究人员将测定已加入长期研究计划的4000名英国人的全基因组序列,其中一半的研究是针对英国的双胞胎来进行的,另一半则是针对父母与子女来开展。Durbin在英国维康基金会桑格研究所工作,他表示该项目将寻求发现每个人基因组中插入和缺失的位点,以便将这些突变位点与其不适的症状联系起来。他强调说,许多人都是自愿加入到研究计划,从出生起,他们就被研究人员所跟踪观察,许多生理指标也都经过了反复的测量。

另外的6000个人则只是测定其外显子序列,即编码蛋白的那部分基因。Durbin表示,参与外显子测序的人都得有“特别突出的表型”,这样就有利于将某一疾病定位到特定的基因上。其中,2000人是极度的肥胖;3000人患有神经元发育障碍;另外1000人则患有先天性心脏病等比较稀少的疾病,这一情形被认为是多基因相互作用的结果。

Durbin说,这一新的项目将建立在新技术发展的基础之上,同时也将吸取国际千人基因组计划的经验教训。但与新计划不同的是,国际千人基因组计划仅仅是记录了人类的遗传变异。

随着DNA测序费用的快速降低,其他一些分析基因组的生物医学项目也如雨后春笋般出现。对此,Durbin表示维康基金会的这项计划是同类项目里的“高端产品”,跟这项计划最具可比性的项目要数美国经济刺激法案资助的糖尿病人基因组计划,而该计划也仅仅是测定3500名糖尿病患者的基因组序列。

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