上周出版的《Science》杂志封面展示了我们熟悉的模式生物——秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）。由美国耶鲁大学、麻省理工学院、加拿大多伦多大学等多个研究机构组成的研究小组，报道了这种模式生物以及另一种模式生物——黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）的详细基因表达分析结果。这两篇发表在《Science》上的文章属于modENCODE计划的研究成果。

随着测序技术的迅猛发展，基因组测序研究得以快速推进。然而，尽管基因组测序逐渐深入，科学家们对基因组如何指导细胞生长和组织发育这一过程中的各种机制仍了解有限。ENCODE计划正是希望在这一领域取得突破。

2003年，美国启动了ENCODE计划（DNA元素百科全书），主要目标是建立人类基因组中生物功能关键性元素的目录。2007年，美国国家人类基因组研究协会（NHGRI）又拨款5700万美元，资助在ENCODE计划基础上建立的modENCODE计划（模式动物ENCODE项目），即模式动物“生命百科全书”项目。

ENCODE计划的主要目的是整合物种的描述、图片、分布地图、视频、声音以及该物种的基因组和所有相关科学论文的链接等。在这两篇最新文章中，研究人员对线虫和果蝇的转录模式及基因表达等方面进行了分析和数据收集。由于这两种重要的模式动物拥有许多与人类相似的基因组，这一研究意义重大，有助于了解人类生理机能及疾病发生机制。

研究人员首先收集了在线虫整个发育过程中，基因组中237个与基因结构、RNA表达及染色质调节等相关的数据集。然后对这些数据进行分析，从而获得了一个更完整和精确的描述个体基因及其转录和表达的模型。

同时，该研究还分析了超过700个关于果蝇基因表达详细情况的数据库。研究人员分析了这些果蝇基因组中机体与功能之间的联系，并表示这一研究结果有助于更精确地预测基因功能、组织和发育阶段的调节因子以及基因表达水平。

这两项研究首次发现了线虫和果蝇基因组中的高占据标靶区域（HOT区域）。在这些区域中，DNA结合了超过15种不同的转录因子。这不仅为我们提供了这两个关键模式生物的功能信息，也有助于解决人类的相关问题。