生物节律调控着一系列发育和代谢过程，使生物体能够适应环境变化。关于植物抗真菌病原体Hyaloperonospora arabidopsidis（该病原体在拟南芥中引起绒毛状霉菌病）能力的研究显示，植物先天免疫系统与生物钟之间存在密切联系。中央节律调控器CCA1被发现调控一组参与R基因介导防卫反应的新基因。这一机制使植物能够在黎明时分（此时病原体通常散播孢子）提前“预测”并抵御感染。