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学术索引

颠覆百年定论:肺部常驻菌Prevotella竟能在氧气中存活,微生物生存法则被改写

一项来自密歇根大学的研究挑战了持续百年的微生物学假设:肺部常见菌Prevotella melaninogenica一直被归类为专性厌氧菌,却能在5-8%氧气浓度下生长,并短暂耐受21%氧气。研究者利用实时传感器和RNA测序发现,该菌具备消耗氧气及应对氧化应激和DNA损伤的机制。Prevotella在健康人肺部约占微生物群10%,在哮喘和COPD患者中平均高达13%。这一发现提示细菌的耐氧能力可能呈谱系分布,而非传统二分法,为理解肺部微生物组功能及慢性肺病治疗提供了新视角。...

2026-09-11 542 0

新型RNA测序平台突破标准检测局限:为罕见病患者提供分子诊断

费城儿童医院研究团队开发的新型RNA测序平台STRIPE,能够对全长RNA分子进行深度测序,为罕见病患者的分子诊断提供新途径。该技术突破了传统DNA测序仅20%-50%诊断率的局限,通过直接观察RNA加工异常,在标准检测阴性的患者中新发现5例诊断。STRIPE成本约100美元/样本,适用于临床易获取的皮肤成纤维细胞和血液样本,有望成为基于RNA的精准医学基础。...

2026-04-23 194 0
《自然·通讯》:科学家成功绘制大鼠基因功能图谱

《自然·通讯》:科学家成功绘制大鼠基因功能图谱

复旦大学药学院石乐明课题组与美国FDA等单位合作,成功绘制出涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠基因功能图谱,相关成果发表于《自然·通讯》。该图谱利用RNA测序技术分析了Fischer 344大鼠的320个样本,揭示了大量未知功能基因及其在不同组织、年龄和性别中的差异表达,对药物安全性评价和个性化医疗具有重要意义。...

2014-04-02 97 0
RNA测序解析白血病转录组

RNA测序解析白血病转录组

巴塞罗那基因组调控中心的研究团队利用RNA测序技术,对慢性淋巴细胞白血病(CLL)的转录组进行了深入分析,揭示了CLL相关基因和突变的功能图谱。研究发现,CLL与正常B细胞之间存在数千个差异表达的转录元件,包括蛋白编码基因、非编码RNA和假基因,并鉴定出CLL特异性的剪接模式。基于转录组特征,患者被分为两个预后不同的亚类,其差异与B细胞受体激活相关。该研究为CLL的个性化治疗提供了分子基础。...

2014-03-02 268 0

中美科研人员成功构建大鼠转录组图谱

中美科研人员利用高通量RNA测序技术,对Fischer 344大鼠的11种器官和4个发育阶段共320个样本进行测序,构建了包含40064个基因和65167种转录物的大鼠转录组图谱。该图谱揭示了基因表达的年龄、性别和器官特异性模式,为药物毒性测试和疾病机制研究提供了重要资源。研究成果发表于《自然·通讯》。...

2014-02-17 203 0

Nature子刊:RNA测序鉴定小胶质细胞独特表达基因

马萨诸塞州综合医院的研究者采用直接RNA测序技术,鉴定了一组小胶质细胞独特表达的基因,称为sensome。这些基因帮助小胶质细胞感知致病组织、毒素或损伤细胞。研究比较了年轻和年老小鼠的sensome,发现衰老过程中神经毒性相关基因下调,神经保护基因上调。该发现为理解小胶质细胞在正常大脑和神经退行性疾病中的作用提供了新视角,并为阿尔茨海默病和帕金森病的治疗带来新方向。...

2013-11-25 166 0

大规模平行测序揭示ALS关键蛋白靶点

俄勒冈健康与科学大学的研究人员通过大规模平行RNA测序,发现ALS相关蛋白TDP-43的缺失和过表达激活不同的分子通路。研究利用果蝇模型揭示了TDP-43在突触传导和Wnt/BMP通路中的新调控机制,为神经退行性疾病的治疗提供了新靶点。...

2012-07-21 247 0

自闭症的大脑变化比以前已知的要广泛得多

加州大学洛杉矶分校领导的一项新研究发现,自闭症的大脑变化在整个大脑皮层中是全面的,不仅限于传统上认为影响语言和社交行为的特定区域。研究分析了112名自闭症患者死后脑组织的11个皮质区域,发现几乎所有区域都有基因表达变化,其中视觉皮层和顶叶皮层变化最大。这为理解自闭症的分子机制提供了关键起点,有望推动新疗法开发。...

2006-10-16 199 0

利用RNA测序技术完成炭疽杆菌基因组转录组分析

美国乔治亚理工学院科学家利用RNA测序技术成功解析了炭疽芽孢杆菌的完整转录组,实现了对5000多个基因表达和调控的高分辨率观察。该研究克服了传统方法只能逐个基因分析的局限,为细菌基因调控研究提供了新工具,并有望推动抗生素发现和微生物工程设计。...

2009-03-31 44 0

深度测序揭示人类转录组前所未有的全貌

德国科学家利用下一代测序技术对人类转录组进行深度分析,揭示了前所未有的复杂性和可变性。研究发现50%的转录子对应特定基因组区域,RNA测序比微阵列多探测25%的基因,并鉴定出超过94000个剪接位点,其中4000多个为全新发现。该研究为哺乳动物基因组注释提供了新视角,表明转录过程高度动态和可变。...

2008-07-13 52 0

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