来自美国康州布兰福德6月25日的消息，知名癌症研究所——达纳-法伯癌症研究所中心、博德研究院与454生命科学有限公司（454 Life Sciences Corporation，纳斯达克代码：CRGN）的研究人员在《自然·医学》网络版杂志上联合发表了一种在癌症基因极低水平变异检测方面的新方法。这种基于454平台的新方法可以在分子水平上识别稀少的癌症相关遗传突变，可能成为一种潜在的个性化治疗手段。

目前已知遗传突变使得一些肿瘤细胞对化疗产生反应，但另一些突变却导致肿瘤细胞对药物治疗产生抵抗。从历史上看，癌症研究一直被肿瘤样品中细胞复合成分所阻碍，而传统的高成本低效率测序方法更是主要瓶颈。此前，454公司在《自然》杂志上提出了一种高效低成本高通量的测序方法，可快速对整个基因组进行测序。

研究人员从22名肺癌患者身上获取肿瘤样品，分析了其表皮生长因子受体（EGFR）五个外显子的突变——EGFR基因是几种新型抗癌药物（EGFR抑制剂）的靶标。调查结果表明，454测序方法可能使EGFR突变成为预测患者对EGFR抑制剂治疗效果的生物标志物。

达纳-法伯癌症研究所中心的马修·迈耶森博士认为：“肿瘤DNA分析十分复杂，因为患者样品中肿瘤细胞的数量参差不齐，而且许多肿瘤的异质性导致难以实现精确测序，而这正是个性化治疗所需要的。454公司的这种方法可能是解决异源癌症样品分子诊断，以及为患者筛选靶向癌症治疗方法的手段之一。”这一技术也被应用于其他研究所，J·克雷格·文特尔研究所人类基因组医学部主任罗伯特·斯特劳斯伯格表示：“我们已经在目标基因医学测序中应用了454测序方法。”

有关测序的话题，随着各种测序技术的进步已有许多突破性进展。例如，新一代测序技术（如Illumina、华大基因的测序平台）已大幅降低成本并提高通量，使得大规模癌症基因组学研究成为可能。此外，液体活检技术也利用高通量测序检测循环肿瘤DNA，为癌症早期诊断和疗效监测提供了新途径。

（生物通；张迪）