2007年，科技部发布了《国家重点基础研究发展计划（973计划）2007年度立项项目前两年经费预算和2004年度立项项目后三年经费预算》的初步方案，并公开征求意见。该预算依据《国家重点基础研究发展计划专项经费管理办法》进行编制，涵盖了植物发育、代谢调控、农业鼠害、生物质能、神经退行性疾病、癌症、干细胞等多个前沿研究方向，总拨款金额从数百万元至一千八百余万元不等。这份预算方案体现了当时国家对基础研究的高度重视，也为后续十多年间我国在生命科学、生物技术、医学及交叉领域的突破奠定了重要资金基础。

在生物医学领域，项目包括抑郁症和精神分裂症的基因环境影响研究、重大心脏疾病分子机理、乙型肝炎重症化机制、脑发育调控、干细胞定向分化等，反映了当时对精神疾病、心脑血管疾病、传染性疾病以及再生医学的优先支持。此外，纳米生物医学、微流控、蛋白质组学等新兴技术也获得了专门资助。尽管如今大部分项目早已结题，但此次公示的历史文件仍是观察中国基础研究战略布局演变的重要资料。