单细胞技术与Hi-C的结合:GAGE-seq实现三维基因组与转录组同步分析
本文介绍了2024年发表在《自然-遗传学》上的GAGE-seq技术,该技术通过微流控平台实现了单细胞中三维基因组结构与转录组的同步分析。文章详细阐述了GAGE-seq的原理、优势及其在干细胞分化、造血干细胞研究中的应用,揭示了三维基因组异质性与转录状态的直接关联,并展望了其在4D基因组、癌症研究和发育生物学中的潜力。...
本文介绍了2024年发表在《自然-遗传学》上的GAGE-seq技术,该技术通过微流控平台实现了单细胞中三维基因组结构与转录组的同步分析。文章详细阐述了GAGE-seq的原理、优势及其在干细胞分化、造血干细胞研究中的应用,揭示了三维基因组异质性与转录状态的直接关联,并展望了其在4D基因组、癌症研究和发育生物学中的潜力。...
2024年9月27日,马克斯·普朗克分子遗传学研究所的研究人员在《自然-遗传学》发表解读,揭示了早期小鼠发育过程中失活X染色体的三维结构重塑机制。研究利用染色质构象捕获技术,发现失活过程经历两步压缩:首先在Xist位点形成兆碱基结构域,随后由Dxz4介导形成超级结构域。该模型阐明了发育阶段特异性的染色质折叠机制,为理解X染色体失活和三维基因组调控提供了新范式。...
2026年2月6日,《自然-遗传学》发表研究,揭示由Polycomb复合物维持的三维染色质结构能够记录细胞过去的表观遗传扰动事件,并在扰动消除后长期维持基因表达和基因组折叠模式的改变。该发现挑战了传统观点,首次证明三维基因组结构本身可作为独立、稳定的记忆载体,为理解疾病易感性和治疗耐药提供了新视角。...
上海交通大学吴强团队在《细胞》发表研究,利用CRISPR技术反转CTCF位点,揭示DNA线性序列如何编码三维基因组高级拓扑结构。该发现阐明了CTCF方向性在染色质环化和基因调控中的作用,为理解基因组功能及疾病机制提供新视角,对精准医疗具有重要推动意义。...
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一项由Suketu Patel领导的研究,利用经典的斯特鲁...