生物信息学工具全景综述:从序列分析到多组学整合
摘要 生物信息学工具是生命科学研究从数据到知识转化的核心驱动力 随着高通量测序技术的持续革新和多组学数据的爆炸式增长 生物信息学工具的数量和复杂度已达到前所未有的水平 截至2026年初 该领域呈现出三 关键词:蛋白质、单细胞测序...
摘要 生物信息学工具是生命科学研究从数据到知识转化的核心驱动力 随着高通量测序技术的持续革新和多组学数据的爆炸式增长 生物信息学工具的数量和复杂度已达到前所未有的水平 截至2026年初 该领域呈现出三 关键词:蛋白质、单细胞测序...
两个世界 一个目标 在过去的五年里 两个技术浪潮交汇了 空间转录组学 Spatial Transcriptomics 10x Visium Slide-seq MERFISH Xenium 等技术使得 关键词:淋巴、学习...
两个世界 一个目标 在过去的五年里 两个技术浪潮交汇了 空间转录组学 Spatial Transcriptomics 10x Visium Slide-seq MERFISH Xenium 等技术使得 关键词:淋巴、学习...
导语 多发性硬化症 MS 是一种中枢神经系统的炎症性疾病 以髓鞘脱失和进行性神经退行性变为特征 尽管人们对MS的免疫病理机制已有较多了解 但不同白质病变类型如何起始 进展以及它们之间如何相互转化 仍然 关键词:空间转录组、RNA...
2024年《自然·神经科学》发表最新研究,首次通过深度单细胞体RNA测序和空间转录组学,系统揭示人类背根神经节神经元的分子图谱。该成果为理解温度、触觉、疼痛和瘙痒的神经基础及精准治疗开发提供重要科学依据。...
近期《自然-通讯》发表研究,利用单细胞与空间转录组学技术,首次构建人类牙齿发育时空分子图谱,揭示上皮与间充质细胞在牙本质生成中的动态互作机制。研究鉴定关键信号通路(TGF-β、Wnt、FGF)及间充质祖细胞亚群,为牙齿再生与组织工程提供精准分子靶点。...
空间Perturb-seq技术通过结合CRISPR基因扰动与高分辨率空间转录组学,实现了在完整组织架构下的单细胞功能基因组学研究。该方法不仅保留细胞空间信息,还能解析基因扰动对微环境的连锁反应,推动功能基因组学向原位解析迈进,并在肿瘤微环境等领域展现出广阔应用前景。...
《自然·通讯》发表的研究利用单细胞与空间组学技术,绘制了胶质母细胞瘤局部与远端侵袭的分子蓝图。研究发现侵袭性细胞亚群经历转录状态重编程,局部侵袭细胞上调细胞骨架重塑基因,远端侵袭细胞富集血管拟态通路。转录因子网络和肿瘤-微环境互作驱动侵袭异质性。该研究识别出SOX2等潜在治疗靶点,为抑制GBM扩散提供了新策略。...
空间转录组学技术虽能保留组织空间信息,但测序点常混合多种细胞类型。DANST算法引入深度域对抗神经网络,消除批次效应并保留细胞特异性信号,在跨平台数据中鲁棒识别稀有细胞群,无需单细胞参考即可精准推断细胞比例,为肿瘤微环境等研究提供有力工具。...
本研究利用单细胞RNA测序与空间转录组技术,深入剖析了脑转移瘤微环境中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的异质性及其功能特征。研究发现,脑转移瘤中的CAFs表现出独特的分子图谱,并与肿瘤细胞及免疫微环境存在复杂的交互作用。该成果揭示了CAFs在脑转移过程中的关键调控机制,为开发针对脑转移瘤的精准免疫治疗策略提供了重要的理论依据与潜在靶点。...
霍华德·休斯医学研究所(HHMI)旗下的Janelia研究...
日本研究团队开发出一种基于银纳米颗粒的DNA编...
香港大学和佐治亚大学研究人员在《Aging-US》期刊...
胶质母细胞瘤是一种侵袭性极强的致命性脑癌,...
一项发表于《自然》杂志的最新研究,开发出一...
在消失二十余年后,极度濒危的科苏梅尔侏儒狐...