单细胞与空间组学 从“果汁”到“果盘”:单细胞RNA测序(scRNA-seq)核心原理与新手入门指南
本文详细介绍了单细胞RNA测序(scRNA-seq)的核心原理、技术流程及新手入门指南。通过生动的比喻解释了单细胞测序与批量测序的区别,阐述了液滴微流控技术的三大关键步骤,并提供了实验设计、样本制备和数据分析的实用建议,帮助研究者掌握这一革命性技术。...
本文详细介绍了单细胞RNA测序(scRNA-seq)的核心原理、技术流程及新手入门指南。通过生动的比喻解释了单细胞测序与批量测序的区别,阐述了液滴微流控技术的三大关键步骤,并提供了实验设计、样本制备和数据分析的实用建议,帮助研究者掌握这一革命性技术。...
本文回顾了单细胞RNA测序技术在秀丽隐杆线虫研究中的应用进展,探讨了其在细胞发育、神经生物学及衰老研究中的核心应用,并展望了未来的技术挑战与发展方向。...
剑桥大学开设的单细胞RNA-seq数据分析课程,系统讲解从实验设计到高级分析的全流程,包括质量控制、标准化、降维、聚类、差异表达、轨迹推断等核心内容。课程基于R语言,提供Docker镜像确保可复现性,开源共享,适合生物信息学研究人员和实验生物学家学习。...
FineST是一种创新的计算框架,通过对比学习整合组织学图像与空间转录组数据,成功实现细胞核分辨率的基因表达解析。该方法在多种组织样本中验证了其高效性,能够精确识别细胞亚型并进行高分辨率的配体-受体相互作用分析,为肿瘤微环境和疾病机制研究提供了强有力的工具支持。...
苏黎世联邦理工学院和罗氏人类生物学研究所的研究人员通过单细胞测序确定了表观遗传调控细胞分化的机制,这项研究有助于理解人类细胞发育及其潜在的表观遗传机制。...
美国哈佛大学医学院和瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员开发出一种新方法,通过分析细胞内mRNA的动态变化,将细胞活动的静态快照转变为动态短片,预测细胞未来几小时内的状态。该方法基于数学模型,准确性极高,有助于深入理解器官发育、药物反应及神经发育障碍如精神分裂症和自闭症。...
张鹍教授的团队在PNAS上发表了一项新的单细胞测序方法,通过微流体反应器法实现了对单细胞基因组的准确测序和单倍体分型,显著提高了测序的精度和准确性。该技术有广泛的应用前景,特别是在检测循环肿瘤细胞和体外受精胚胎筛选等领域。...
《自然》杂志2023年7月推出单细胞生物学特刊,系统阐述了该领域的最新进展。特刊涵盖细胞谱系追踪、人类细胞图谱构建、单细胞免疫学分析以及染色体组织在细胞周期中的动态变化等前沿研究,展示了单细胞技术在揭示细胞多样性和功能方面的革命性作用。...
图片来自Spencer Phillips The European Bioinformatics Institute 在一项新的研究中 来自欧洲生物信息研究所 EMBL-EBI 英国剑桥大学 韦尔科姆 关键词:单细胞测序、细胞衰老...
中国科学院武汉病毒研究所龚鹏研究员团队报道了首个病毒RdRP转位中间体晶体结构,揭示了RdRP模板和产物双链在转位中的不对称运动模式,为进一步剖析转位机制提供了关键信息。...
张鹍教授的团队在PNAS上发表了一项新的单细胞测...