单细胞与空间组学 CaMPARI-seq:功能性神经元转录组学揭示视觉流处理的神经环路组织
视觉流 optic flow 当动物运动时 视觉场景在视网膜上形成的大规模运动模式 是控制眼球和身体运动以维持平衡和稳定视线的重要信息 对于侧眼动物 如斑马鱼 区分旋转和水平移动的视觉流模式至关重? 关键词:神经元、神经环路...
视觉流 optic flow 当动物运动时 视觉场景在视网膜上形成的大规模运动模式 是控制眼球和身体运动以维持平衡和稳定视线的重要信息 对于侧眼动物 如斑马鱼 区分旋转和水平移动的视觉流模式至关重? 关键词:神经元、神经环路...
本文介绍了2024年发表在《自然-遗传学》上的GAGE-seq技术,该技术通过微流控平台实现了单细胞中三维基因组结构与转录组的同步分析。文章详细阐述了GAGE-seq的原理、优势及其在干细胞分化、造血干细胞研究中的应用,揭示了三维基因组异质性与转录状态的直接关联,并展望了其在4D基因组、癌症研究和发育生物学中的潜力。...
本文介绍了一种名为popV的新方法,通过集成多种算法的预测结果并结合细胞本体论,量化单细胞类型标注的不确定性。该方法能够有效区分高置信度和低置信度的细胞标注,指导人工审查并提升注释效率,在大规模单细胞数据分析中具有重要应用价值。...
杜克大学医学院研究团队开发了一种DART-seq小鼠模型,首次实现了在单细胞分辨率下绘制小鼠大脑的m6A图谱。研究发现,不同脑区和细胞类型之间的m6A甲基化具有高度共享性,同时揭示了神经元和小胶质细胞中的差异甲基化特征。该研究为探索RNA修饰在神经系统发育、功能及衰老中的细胞类型特异性作用提供了重要工具。...
2024年《自然·神经科学》发表最新研究,首次通过深度单细胞体RNA测序和空间转录组学,系统揭示人类背根神经节神经元的分子图谱。该成果为理解温度、触觉、疼痛和瘙痒的神经基础及精准治疗开发提供重要科学依据。...
本文系统介绍了神经科学领域单细胞基因组学的实验流程,重点解析正交与功能验证技术平台及其挑战。综述为研究者提供了从细胞图谱到机制阐释的科学路线图,推动神经科学研究向因果机制深入发展。...
本文综述了单细胞表观基因组学和空间分辨转录组学在神经科学领域的最新进展,系统对比了主流技术平台(MERFISH、Slide-seq、Visium),阐释了这些前沿技术如何推动细胞机制解析和组织空间互作网络研究,为神经科学者提供了方法选择的权威参考。...
本文系统综述了单细胞与单核基因组学技术在神经系统细胞异质性和命运转变研究中的应用。内容涵盖分子细胞图谱的构建标准、实验设计关键、数据整合与批次效应校正,以及细胞类型分类的金标准,为神经科学领域提供了最新研究路线图。...
本文系统介绍了通过单细胞质谱流式技术绘制小鼠发育中大脑的蛋白质表达图谱,涵盖2400万余细胞、85个分子细胞簇,揭示了神经和胶质细胞发育轨迹及蛋白质-RNA表达差异。该成果为神经发育研究提供了高维度、可扩展的单细胞蛋白质组学平台和重要资源。...
2025 年,10x Genomics 推出了一系列具有里程碑意义的技术革新,包括 VISTA-FISH、MALDI-MSI、REFLEX、CRISPore-seq 和虚拟细胞。这些技术打破了传统分析的边界,让“活体成像”、“代谢组学”与“数字孪生”完美融入了现有的组学平台。...
张鹍教授的团队在PNAS上发表了一项新的单细胞测...