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基因组学 PLoS Comput Biol & Sci Rep:新型工具助力超级基因组分析

伊坎西奈山医学院开发了两种新型基因组分析工具:MEGENA和SuperExactTest。MEGENA通过将基因表达数据映射到三维球体,高效识别复杂疾病中的调控网络;SuperExactTest则提供统计框架评估多组基因集交叉点的显著性。两项工具在癌症基因组图谱数据中验证了其优越性能,有望加速遗传疾病机制研究和靶点发现。...

2015-12-22 20:24:56 171
北京基因组所等开发基于K-mer的基因组组分分析数据库

基因组学 北京基因组所等开发基于K-mer的基因组组分分析数据库

中国科学院北京基因组研究所与英国伦敦大学学院合作开发了基于K-mer算法的基因组组分分析数据库KGCAK。该数据库整合了超过8000个基因组数据,涵盖多种生物,提供K-mer向量计算、基因组复杂度评估及可视化工具,为系统发生树构建和物种关系研究提供平台。...

2015-11-03 21:47:51 100

基因组学 芝麻全基因组关联分析取得突破性进展

中国农科院油料作物研究所张秀荣团队与中国科学院合作,完成了芝麻高密度单倍型图谱构建和主要农艺性状的大规模全基因组关联分析,发现了一批与芝麻重要性状相关的关联位点和候选基因,为油料作物的遗传改良提供了新思路。...

2015-10-28 22:10:53 150

基因组学 基因测序发展新态势:上游发展三四代技术,下游完成样本积累

本文深入分析了基因测序行业的发展态势,指出上游正发展三四代测序技术,下游则致力于完成样本积累。文章从精准医疗的基础出发,探讨了基因测序的技术原理、产业链结构、市场前景及国内外商业模式。强调短期应关注具备强大基因组样本和临床表型数据获取能力的公司,长期则需聚焦于三四代测序技术的研发,以突破当前测序读长限制,实现疾病的精准预防、诊断和治疗。...

2015-10-20 20:58:36 62