全基因组测序助力Nature癌症研究重大发现

来自圣犹儿童研究医院，华盛顿大学医学院等处的研究人员发表了题“The  genetic  basis  of  early  T-cell  precursor  acute  lymphoblastic  leukaemia”的文章，利用全基因组测序方法，分析了重要儿童白血病的机制，并提出了一种有助于该疾病治疗的新型定向治疗方案是首次针对儿童基因组分析，获得的系列重大成果。相关成果公布在Nature杂志上。

文章的通讯作者是圣犹大儿童研究医院病理系的James  R.  Downing和Charles  G.  Mullighan，这一研究组曾通过对242名患者基因组的350,000位点进行了扫描，发现了一个与急性淋巴性白血病相关的重要突变。对于这一最新的研究，Mullighan博士表示，“我们发现的这个基因表达谱突变说明，患有这种儿童白血病的病人也许能通过急性髓系白血病相关的治疗药物获得缓解。”

起源于早期体T细胞（ETPs）的急性淋巴细胞白血病（acute  lymphoblastic  leukaemia，ETP  ALL）是一种儿童白血病的独特生物次类型，这一疾病是由圣犹大儿童研究医院的研究人员发现，大约占T-ALL中12%的比例。目前的治疗方法对许罹患ETP-ALL的病人不起作用，无法进入缓解期，只有大约30%-40%的病人能成为长期幸存者。

这项研究中，研究人员测序分析了12位圣犹大ETP-ALL病患的基因组，以及健康对照组的基因组，而且还在另外94位患有ETP-ALL或者其它类型的T细胞ALL小患者样品中，筛查同样的突变。

结果他们发现了只在ETP-ALL病患样品中出现的突变，这将研制这一疾病的遗传检测识别方法，以及治疗新靶标提供了依据，也有助于开发积极的定向治疗方法。

研究人员也发现，这些突变主要是出现在调控细胞因子受体和Ras信号作用通路的基因中，这些基因突变很多是因为染色体重排而出现的，而这样的重排产生新的嵌合式融合基因，这些突变会被高频率激活，而组蛋白修饰基因中的突变则被高频率钝化。这种突变模式与恶性骨髓瘤的突变模式相似，说明以骨髓为目标的治疗方法，比如能够抑制细胞因子受体和JAK信号作用的高剂量“阿糖胞苷”定向疗法，对于治疗ETP-ALL也许会有效。

圣犹大科学部主任William  E.  Evans博士表示，“这是儿童癌症基因组计划，首次针对儿童癌症基因组分析的系列重大发现，这一计划将于2013年完成600个儿童基因组序列的测定。”
(责任编辑：glia)

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