结直肠癌是英国第四大常见癌症，也是癌症相关死亡的第二大原因。新发现可能有助于临床医生更好地了解这种疾病的发展机制、侵袭性潜力以及患者对不同治疗的反应。

研究团队分析了来自9,000多名癌症患者的全基因组测序数据，结果发表在《科学转化医学》上。该研究挑战了“每种癌症类型都有其独特的微生物特征”这一广泛假设。

“这项研究改变了我们对微生物在癌症中作用的看法，”来自东安格利亚大学诺里奇医学院的首席研究员亚伯拉罕·吉哈维博士说。

科学家如何分析肿瘤微生物

为了开展这项研究，研究人员检查了Genomics England的DNA序列数据，这些数据来自11,735个癌症样本，涵盖22种不同的癌症类型。

“当你收集癌症DNA序列时，你还可以从样本中包含的微生物DNA中获得信息，”Gihawi博士说。“我们想要确定每个样本中存在的微生物的精确DNA组成。因此，我们开发了计算机程序来去除人类DNA并分析剩余的微生物DNA。然后我们将这些信息与患者有关癌症类型和临床结果的临床数据相关联。”

“我们的发现挑战了之前的说法，即每种癌症类型都有独特的微生物特征或指纹。但重要的是，随着全基因组测序在医院中变得越来越普遍，我们表明，观察肿瘤样本中的微生物可能成为改善癌症护理的强大工具，而无需额外成本。”

结直肠癌显示出独特的微生物特征

分析揭示了一个清晰的模式：在所有研究的癌症中，只有结直肠肿瘤始终表现出独特且可识别的微生物群落。

“我们的结果表明，只有结直肠肿瘤具有明显可识别的微生物群落。我们发现这些微生物特征非常特异，可以准确区分结直肠肿瘤和其他肿瘤。我们希望这可以帮助医生更准确地诊断疾病，并帮助研究人员研究结直肠癌中发现的微生物。”

该研究还指出了更广泛的临床用途。研究人员发现，在口腔癌中，某些病毒（例如HPV）的检测结果比目前的一些诊断测试更准确。他们还发现了罕见但危险的病毒，包括人类T淋巴细胞病毒-1，它可以在体内保持休眠状态，随后导致癌症的发展。

微生物与生存和治疗反应有关

研究结果表明，微生物的作用可能不仅仅是与癌症并存。在某些情况下，它们似乎与患者的病情有关。

“我们发现某些类型的细菌与某些肉瘤病例的较差存活率有关。这可能会导致针对这些类型的癌症进行更多的研究和治疗选择，”吉哈维博士说。“我们发现的最令人兴奋的事情之一是，在一些肉瘤病例中，特定细菌的存在与更高的存活率有关。这表明微生物有一天可能会帮助医生预测患者对治疗的反应如何，并开辟新的治疗方法。”

全基因组测序作为临床工具

专家表示，这项工作凸显了基因组测序在现代医学中日益增长的重要性。

来自UEA诺维奇医学院的Daniel Brewer教授表示：“这项研究凸显了全基因组测序在识别HTLV-1和乳头瘤病毒等致病微生物方面日益增长的临床价值，否则这些微生物可能无法被发现。通过揭示这些隐藏的感染并提供对癌症预后（尤其是肉瘤）的洞察，它展示了基因组分析如何成为精准医学中不可或缺的工具。研究结果还表明，在某些情况下，口腔癌可能是一个密切的诊断考虑因素，进一步强调了全面的基因组分析在临床决策中的重要性。”

合作与资助

该项目由东英吉利大学牵头，涉及多个机构的研究人员，包括利兹大学、Quadram研究所、牛津纳米孔技术公司、伦敦癌症研究所、曼彻斯特大学、国家健康与护理研究所曼彻斯特生物医学研究中心、雅典大学（希腊）、利物浦大学、剑桥大学医院NHS基金会信托、伦敦大学学院、南安普顿大学、北卡罗来纳大学（美国）和厄勒姆研究所。该研究的资金由Big C癌症慈善机构和英国前列腺癌组织提供。