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从点击化学中“复活”万古霉素:小分子抑制剂 pghi-4 逆转超级细菌耐药性

2026-07-28 11:27 John Moses, Howard C Nature Communications 阅读 0
核心摘要: 抗生素耐药性正使许多经典药物失效,临床治疗面临严峻挑战。冷泉港实验室 John Moses 团队与合作者另辟蹊径,利用多样性导向点击化学(DOC)构建了含 150 余种化合物的分子库,从中筛选出小分子 pghi-4。该分子能特异性抑制细菌分泌抗原 A(SagA)——一种参与肽聚糖重塑并导致万古霉素耐药的关键酶。与万古霉素联用后,pghi-4 成功恢复了万古霉素对耐药粪肠球菌的杀菌活性。这一成果并非源自针对性筛选,而是基础化学研究的意外收获,为挽救老牌抗生素、应对多重耐药菌提供了全新思路。该策略有望拓展至结

当细菌演化出抵抗机制,昔日效力强大的抗生素便会沦为摆设。以万古霉素为例,这一临床最后的防线正面临越来越广泛的耐药威胁,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、艰难梭菌以及耐万古霉素肠球菌等“超级细菌”常使其束手无策。传统药物研发多聚焦于寻找全新结构抗生素,但面对耐药速度远超新药上市的现实,科学家开始转换思路:通过添加“抗生素佐剂”——不直接杀菌而是瓦解细菌耐药防御的小分子,让老旧抗生素重获新生。

从点击化学到抗生素佐剂:DOC 分子库意外贡献首个抑制剂

冷泉港实验室的 John Moses 教授长期致力于发展快速高效构建小分子的化学反应方法,其团队开发的“多样性导向点击化学”(diversity-oriented clicking,DOC)能够在短时间内组装出结构多变的大量化合物。利用这一平台,Moses 实验室建立了一个包含 150 余种独特分子的化合物库,并慷慨地向合作者开放,以加速药物发现。正是在与斯克里普斯研究所 Howard Hang 课题组的合作中,该分子库展现出了对抗耐药菌的潜力。他们聚焦于一个名为分泌抗原 A(secreted antigen A,SagA)的细菌酶,该酶被证实与万古霉素耐药密切相关。借助该分子库,研究人员筛选到了一个代号为 pghi-4 的小分子,它能有效抑制 SagA 的活性。值得一提的是,pghi-4 最初于 2020 年在 Moses 实验室被发现,当时并非针对抗生素耐药,而是纯粹的基础化学研究产物。

Moses 教授对此表示:“这一发现来自基础化学研究。反应方法的开发让我们找到了参与抗生素耐药的重要酶的首个抑制剂。这是一个我们不断优化的过程,目的是让分子库不断升级,并为合作者提供更多可以利用的资源。” 这段话道出了意外之喜背后的科学逻辑——通过对化学反应本身的理解和创新,研究者得以高效触及传统方法难以开拓的化学空间,从而为生物学问题提供意想不到的分子探针。

靶向肽聚糖重塑:SagA 酶如何成为耐药帮凶

要理解 pghi-4 的作用,必须回到万古霉素的杀菌机制。万古霉素通过与细菌细胞壁前体肽聚糖末端的 D-Ala-D-Ala 二肽结合,阻止细胞壁交联,最终导致细菌裂解死亡。然而,耐药菌如粪肠球菌(Enterococcus faecium)进化出了一套精巧的防御策略:它们将肽聚糖前体的末端二肽转换为 D-Ala-D-Lac,使万古霉素的结合亲和力下降数千倍。这一结构“改造”过程依赖多种酶的参与,而 SagA 正是其中的关键角色。研究显示,SagA 是一种能够重塑肽聚糖结构的酶,它的活性直接与细菌对万古霉素的耐受水平挂钩。当 pghi-4 与 SagA 结合并抑制其功能时,耐药菌无法顺利完成肽聚糖的“伪装”,细胞壁前体恢复为万古霉素可以识别和结合的 D-Ala-D-Ala 形式,从而使抗生素重新发挥杀菌作用。

从实验台到临床潜力:老药新用的普遍性前景

在联合用药实验中,研究人员将 pghi-4 与万古霉素共同作用于耐药粪肠球菌,原本对万古霉素高度耐受的细菌变得敏感,杀菌效果得以恢复——这直接验证了“抑制 SagA 可逆转万古霉素耐药”的核心假说。Moses 强调:“这项工作体现了一种旨在以最纯粹形式加速药物发现的化学哲学。通过使用可靠、稳健且智能的化学反应,我们可以更高效地构建新分子,这正是我们在此采用的方法。” 由于 DOC 平台生成的分子库并非针对单一靶点设计,而是旨在覆盖广阔的化学结构类型,因此它极有可能被重新应用于其他耐药病原体。研究团队已开始考虑将类似策略拓展至耐药结核分枝杆菌等全球重大公共卫生威胁。

这一研究的意义远不止于复活万古霉素本身。它向学界传递了一条清晰信号:在基础化学与生物学的交叉地带,往往埋藏着解决现实临床困境的钥匙;而开放共享的分子库作为公共资源,将极大提高发现新型佐剂的效率。当超级细菌不断挑战人类智慧时,来自冷泉港实验室的这一成果提醒我们,有时候最好的武器并非全新,而是借由巧妙的设计,让旧武器重上战场。


Reference: “Genetic and pharmacological inactivation of peptidoglycan remodeling increases antibiotic susceptibility of vancomycin-resistant Enterococcus faecium” by Kyong T. Fam, Pavan Kumar Chodisetti, Zifei Wang, Joshua A. Homer, Christopher J. Smedley, Seiya Kitamura, Benjamin Silva, Yijun Xiong, Althea Hansel-Harris, Matthew Holcomb, Simeon Babarinde, Adrianna M. Turner, Daria Van Tyne, Ian A. Wilson, Stefano Forli, Benjamin F. Cravatt, Donghyun Park, Dennis W. Wolan, John E. Moses and Howard C. Hang, 16 June 2026, Nature Communications. DOI: 10.1038/s41467-026-74057-1
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