研究人员对涉及多种癌症的蛋白质进行了深入研究，揭示了基因组测序本身无法提供的信息。通过破译癌细胞中蛋白质的行为，研究人员有望开发出抑制驱动癌症进展的关键蛋白质的治疗方法，或触发对癌细胞产生的异常蛋白质的免疫反应。由圣路易斯华盛顿大学医学院、博德研究所等机构领导的临床蛋白质组学肿瘤分析联盟的研究成果发表在《细胞》和《癌细胞》杂志上。
蛋白质相互作用在肿瘤生长中的作用
研究人员分析了涉及10种不同类型癌症的约10,000种蛋白质。这类数据的庞大规模至关重要，许多重要的癌症驱动蛋白在任何单一癌症中都很罕见，如果单独研究肿瘤类型是无法识别的。这些数据还使研究人员能够了解蛋白质如何相互作用以促进癌症生长。如果两种蛋白质的水平相互关联，这表明这两种蛋白质可能作为伙伴发挥作用，破坏这种相互作用可能是阻止肿瘤生长的有希望的方法。
免疫疗法有效性与蛋白质表达
该研究还揭示了免疫疗法的有效性。免疫检查点抑制剂等免疫疗法通常在有大量突变的癌症中效果最好，但即便如此，它们并非对所有患者都有效。研究人员发现，大量突变并不总是导致异常蛋白质的丰富，而异常蛋白质是免疫系统攻击肿瘤时的目标。对于一些癌症，即使突变有可能产生肿瘤抗原，如果没有异常蛋白质表达或表达非常少，这些突变可能无法用于治疗。这可能是解释为什么有些患者对免疫疗法没有反应的原因，即使看起来他们应该会反应。
DNA甲基化在癌症抑制中的作用
研究团队还识别了DNA甲基化模式，这是另一种可以影响基因表达方式的化学改变。这些模式可能是关键的癌症驱动因素。在一个重要发现中，他们确定了一种在某些肿瘤类型中抑制免疫系统的分子开关。
参考信息
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“Integrative multi-omic cancer profiling reveals DNA methylation patterns associated with therapeutic vulnerability and cell-of-origin” by Wen-Wei Liang et al., 14 August 2023, Cancer Cell. DOI: 10.1016/j.ccell.2023.07.013
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“Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis” by Yize Li et al., 14 August 2023, Cancer Cell. DOI: 10.1016/j.ccell.2023.06.009
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“Pan-cancer analysis of post-translational modifications reveals shared patterns of protein regulation” by Yifat Geffen et al., 14 August 2023, Cell. DOI: 10.1016/j.cell.2023.07.013
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“Pan-cancer proteogenomics connects oncogenic drivers to functional states” by Yize Li et al., 14 August 2023, Cell. DOI: 10.1016/j.cell.2023.07.014