描述
本方案适用于大肠杆菌中质粒DNA的大量提取(Maxi-prep),通过碱裂解法结合酚氯仿抽提和乙醇沉淀,可获得高纯度质粒DNA,用于转染、测序等下游实验。以下为详细步骤。
实验步骤
1. 将单个菌落接种于5 mL含50 μg/mL氨苄青霉素(Sigma A-0166)的LB培养基中,37°C剧烈振荡(约250 rpm)培养过夜。
2. 取2.5 mL过夜培养物接种于250 mL含50 μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中,37°C剧烈振荡(约250 rpm)培养过夜。
3. 次日早晨,将培养物于4°C、5000 × g离心15分钟收集菌体。
4. 弃上清,用6 mL冰预冷的裂解缓冲液重悬菌体(轻柔吹打),冰浴10分钟。
5. 加入7.5 mL新鲜配制的氯化钠(BDH 30123)/SDS溶液(Sigma L-4390),仅通过颠倒混匀,冰浴10分钟。
6. 加入7.5 mL冰预冷的3 M乙酸钠(pH 4.6,Qualigens 13905),颠倒混匀约10秒,冰浴20分钟。
7. 于4°C、12000 × g离心5分钟。
8. 将含质粒的上清转移至新离心管,避免吸到白色沉淀,加入DNase-free RNase A(Sigma R-9009)至终浓度20 μg/mL。
9. 混匀后于37°C孵育20分钟。
10. 加入0.5倍体积的Tris平衡酚(pH 8.0,SRL 1624132)和0.5倍体积的氯仿(Qualigens 12305)-异戊醇(Qualigens 21515)混合液,涡旋1分钟,12000 × g离心10分钟。
11. 重复步骤10一次。
12. 将上层水相转移至新离心管,加入1倍体积的氯仿-异戊醇混合液,涡旋1分钟,12000 × g离心10分钟。
13. 将上层水相转移至新离心管,加入2.5倍体积的乙醇(Merck 1.009883.0511),颠倒混匀,于-20°C沉淀过夜。
14. 于4°C、12000 × g离心30分钟回收DNA,用冰预冷的70%乙醇洗涤沉淀,空气干燥。
15. 将干燥的沉淀溶于500 μL水中,产量约为500-750 μg质粒DNA。
16. 使用Shimadzu UV 1601紫外可见分光光度计测定260 nm和280 nm吸光度,评估DNA浓度和纯度。
试剂配方
裂解缓冲液:50 mM葡萄糖,25 mM Tris-HCl(pH 8.0),10 mM EDTA(pH 8.0),使用前加入溶菌酶至终浓度1 mg/mL(可选)。
氯化钠/SDS溶液:0.2 M NaOH,1% SDS(现配现用)。
3 M乙酸钠(pH 4.6):称取408.1 g三水乙酸钠溶于800 mL水,用冰乙酸调pH至4.6,定容至1 L。
耗材与试剂
LB培养基、氨苄青霉素、酚、氯仿、异戊醇、乙醇、RNase A等均为分子生物学级。
提示
1. 所有离心步骤均在4°C进行,以抑制核酸酶活性。
2. 酚氯仿抽提时避免吸入中间相和有机相。
3. 乙醇沉淀可缩短至2小时,但过夜沉淀产量更高。