PAH PvuII B多态性是指苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因内含子3中的一个PvuII限制性酶切位点多态性。该多态性可用于遗传连锁分析或作为遗传标记,在苯丙酮尿症(PKU)的基因诊断中具有潜在应用价值。本文详细描述了该多态性的PCR-RFLP检测方法。
实验步骤
模板:基因组DNA,100-200 ng/反应,反应体积25 μL。
引物:PAHPVUb-1(5' GCCTGAAAGCAATACAGAGG 3')和PAHPVUb-2(5' TGAGGTAGGGATGAAAGACC 3'),各100 ng/反应。
dNTPs:终浓度200 μM each。
缓冲液:终浓度1.50 mM MgCl₂,50 mM KCl,10 mM Tris-HCl pH 8.4。
Taq DNA聚合酶:0.5 U/反应(Perkin-Elmer Amplitaq DNA聚合酶,5 U/μL,货号N808-0145)。
PCR循环程序:95°C预变性5分钟;然后95°C 30秒,58°C 30秒,72°C 30秒,共30个循环;最后72°C延伸5分钟。
产物大小:PCR产物为489 bp。经PvuII酶切后,若存在PvuII位点(纯合子),则产生259 bp和230 bp两个片段;若不存在,则保留489 bp片段。
注意事项:确保DNA质量良好,避免降解。酶切反应需充分进行,建议使用新鲜的限制性内切酶。电泳时使用2%琼脂糖凝胶,以清晰区分片段大小。