描述:PAH基因PvuII A多态性是指位于苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因内含子2近5'端的一个限制性片段长度多态性(RFLP),由限制性内切酶PvuII识别。该多态性可用于遗传连锁分析,辅助苯丙酮尿症(PKU)的基因诊断。
实验步骤:
1. 模板:基因组DNA,每25 μL反应体系使用100-200 ng。
2. 引物:
- 上游引物(PAHPVU2-1):5'-GGC ATG ACT GGA TAC GAT TAG-3',每反应100 ng。
- 下游引物(PAHPVU2-2):5'-CTA GAC TCA GAA TGC CTG GG-3',每反应100 ng。
3. dNTPs:终浓度各200 μM。
4. 缓冲液:终浓度含1.50 mM MgCl₂、50 mM KCl、10 mM Tris-HCl(pH 8.4)。
5. Taq DNA聚合酶:0.5单位/反应(使用Perkin-Elmer Amplitaq DNA聚合酶,5 U/μL,货号N808-0145)。
6. PCR循环程序:
- 95°C预变性5分钟;
- 95°C变性30秒,58°C退火30秒,72°C延伸30秒,共30个循环;
- 72°C终延伸5分钟。
7. 产物大小:PvuII酶切后,野生型(+/+)个体产生374 bp片段,酶切后产生225 bp和149 bp两个片段。