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基因组学

北京基因组所等开发基于K-mer的基因组组分分析数据库

基因组学 北京基因组所等开发基于K-mer的基因组组分分析数据库

中国科学院北京基因组研究所与英国伦敦大学学院合作开发了基于K-mer算法的基因组组分分析数据库KGCAK。该数据库整合了超过8000个基因组数据,涵盖多种生物,提供K-mer向量计算、基因组复杂度评估及可视化工具,为系统发生树构建和物种关系研究提供平台。...

2015-11-03 21:47:51 109

基因组学 芝麻全基因组关联分析取得突破性进展

中国农科院油料作物研究所张秀荣团队与中国科学院合作,完成了芝麻高密度单倍型图谱构建和主要农艺性状的大规模全基因组关联分析,发现了一批与芝麻重要性状相关的关联位点和候选基因,为油料作物的遗传改良提供了新思路。...

2015-10-28 22:10:53 159

基因组学 测序污染有多危险,如何防范与去除?

测序污染是基因组学研究的常见问题,可能导致错误结论。本文分析了污染来源(如PhiX对照、试剂污染、样品混淆),介绍了检测工具(Blobtools-light、ProDeGe、VecScreen)和去除方法(DeconSeq、NCBI筛选),并强调数据责任与未来改进方向。...

2015-10-22 21:47:28 145

基因组学 基因测序发展新态势:上游发展三四代技术,下游完成样本积累

本文深入分析了基因测序行业的发展态势,指出上游正发展三四代测序技术,下游则致力于完成样本积累。文章从精准医疗的基础出发,探讨了基因测序的技术原理、产业链结构、市场前景及国内外商业模式。强调短期应关注具备强大基因组样本和临床表型数据获取能力的公司,长期则需聚焦于三四代测序技术的研发,以突破当前测序读长限制,实现疾病的精准预防、诊断和治疗。...

2015-10-20 20:58:36 74

基因组学 英国万人基因组计划告捷:历时三年斩获数篇Nature

英国万人基因组计划(UK 10K)历时三年,于2015年9月14日在《Nature》发表里程碑成果。该项目对近万人进行测序,涵盖健康与患病人群,包括罕见遗传病及自闭症、精神分裂症等常见疾病。通过分析罕见突变与疾病关联,发现了与骨质疏松症等相关的基因突变(如EN1)。系列成果发表于《Nature》、《Nature Genetics》等期刊,为精准医学奠定基础。...

2015-09-17 16:58:41 163

基因组学 掌上测序仪MinION首次用于人类基因组测序

多伦多大学Gary Bader团队首次使用牛津纳米孔掌上测序仪MinION对人类基因组进行测序,研究了与药物剂量效应相关的三个基因。尽管目前技术仍存在较高错误率,但通过增加测序深度可有效提高准确性,未来有望在临床诊断中发挥重要作用。...

2015-08-24 14:06:18 204