生物信息学与数据库 中科院与复旦大学合作在《Cell Research》发表基于网络的基因加权通路分析方法
中科院与复旦大学合作研究提出了一种基于网络的基因加权通路分析方法,通过整合蛋白质相互作用数据、基因共表达数据和Gene Ontology通路数据库,构建基因功能关联网络,并设计了度量基因相对重要性的方法。该方法提高了生物学通路分析的准确性和可重复性,为基因表达谱数据的研究提供了新的工具。...
中科院与复旦大学合作研究提出了一种基于网络的基因加权通路分析方法,通过整合蛋白质相互作用数据、基因共表达数据和Gene Ontology通路数据库,构建基因功能关联网络,并设计了度量基因相对重要性的方法。该方法提高了生物学通路分析的准确性和可重复性,为基因表达谱数据的研究提供了新的工具。...
美军在伊拉克和阿富汗建立大规模生物数据库,采集上百万人的指纹、虹膜等生物特征,用于追踪可疑人员。2011年坎大哈越狱事件中,35名逃犯因数据库识别被捕。该数据库覆盖约150万阿富汗人和220万伊拉克人,引发隐私侵犯和政治清洗的担忧。文章探讨了生物识别技术在反恐中的效用与伦理风险,强调需平衡安全与隐私。...
2011年5月27日,第七届国际生物信息学研究及应用大会(ISBRA 2011)在长沙枫林宾馆开幕,由中南大学信息科学与工程学院承办。来自全球80多位专家参会,包括5场主题报告和40多场分组讨论,内容覆盖生物医学数据库、比较基因组学、计算蛋白质组学等领域。会议录用36篇论文,由Springer出版社出版。ISBRA是生物信息学领域的重要国际会议,自2005年起已在多国举办。...
近日,国际著名数据库Medline正式收录由中国科学院动物研究所和国际动物学会主办的英文科技期刊《整合动物学》。该刊创刊于2006年,是中国首家英文动物学国际期刊,旨在促进学科交叉,推动动物学发展,已被SCI收录。Medline数据库由美国国立医学图书馆创办,是全球最权威的生物医学文献数据库之一。...
生物信息学是一门高度交叉的学科,利用计算、数学和统计工具理解海量生物学数据,是现代生命科学的数据分析引擎。本文系统梳理了生物信息学在基因组学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、进化与群体遗传学、宏基因组学、结构生物信息学等领域的核心应用,并介绍了序列比对、动态规划、隐马尔可夫模型、机器学习与深度学习等关键技术与算法。生物信息学已从辅助工具演变为核心驱动力,赋能干湿结合、处理大数据、提供全局视角,在基础研究、精准医学、药物研发等领域不可或缺。...
表观基因组学是研究在不改变DNA序列的情况下,基因表达可遗传变化的学科。本文系统介绍了其核心研究内容,包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、染色质三维结构及非编码RNA等方向,并阐述了关键技术与分析方法,如ChIP-seq、ATAC-seq和DNA甲基化数据分析。表观基因组动态变化,在发育、疾病中起关键作用,为精准医学提供新视角。...
进化与群体遗传学是理解生命演化历史和生物多样性的理论基础,结合遗传学、统计学、生物信息学和生态学,研究基因在群体中如何随时间变化。本文系统介绍了群体遗传结构、系统发育分析、群体历史动态和自然选择检测等核心研究方向,以及PCA、STRUCTURE、Fst、PSMC、BEAST等关键技术方法,并列举了人类迁徙、病毒溯源、大熊猫保护、高原适应等应用实例,为相关领域研究者提供参考。...
MANOVA(多变量方差分析)是一种用于同时检验多个因变量组间差异的统计方法,能有效控制假阳性率并揭示变量联合效应。本文详细介绍了MANOVA的核心目的、适用场景、关键假设、常用检验统计量(如Pillai's Trace、Wilks' Lambda)以及与ANOVA的比较。在生物医学、心理学、神经科学等领域,MANOVA常用于分析多指标综合效应,是高通量组学数据初步分析的重要工具。...
中国科学院系统生物学重点实验室开发了SysPTM在线分析平台,整合近50种修饰类型、117349个修饰位点,并提供了四个在线工具用于修饰功能与保守性分析。该平台发表于《分子与细胞蛋白质组学》,为蛋白质翻译后修饰的系统研究提供了数据基础和分析支持。...
宏基因组学是基因组学的前沿分支,直接对环境样品中全部微生物遗传物质进行测序分析,绕开传统培养局限。本文系统介绍其核心研究内容,包括物种分类鉴定、功能基因分析、微生物相互作用、菌株水平分析和病毒组学,并对比16S rRNA扩增子测序与宏基因组鸟枪法测序两大技术路径。宏基因组学在医学、环境、农业等领域具有广泛应用,如肠道菌群与疾病关联研究、新型抗生素发现等。...
乘法作为数字世界的基础运算,其效率对计算机...
多巴胺神经元通过编码预测误差驱动学习。哈佛...
量子计算正处于关键的“成败时刻”。其承诺将...
美国怀特黑德生物医学研究所的研究人员发现,...