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生物信息学与数据库 基因数据库存在泄露个人隐私的漏洞

美国怀特黑德生物医学研究所的研究人员发现，公共基因数据库存在漏洞，可能导致DNA捐助者的身份被泄露。通过交叉引用公开的基因数据和参与者信息，可以识别出参与者的身份。尽管风险较低，但研究者呼吁通过立法加强隐私保护。...

2013-01-25 17:38:07 216

生物信息学与数据库 数据共享：挑战与前景

本文探讨了我国科学数据共享的发展历程、现状与挑战。自2002年首批项目启动以来，共享理念逐渐普及，社会效益显著，如地球系统科学数据共享平台为科研节省大量经费，人口与健康平台提升农村医疗水平。然而，经费不足、人才队伍不稳定等问题依然突出。专家建议加强政策支持、整合数据资源、探索跨学科服务，以推动数据共享的可持续发展。...

2013-01-10 13:09:45 177

生物信息学与数据库 快速准确识别SNP的新方法：适用于低深度测序数据

香港大学与华大基因合作开发了一种基于二项分布算法的快速精确SNP检测方法，能在4小时内完成10倍人类基因组测序数据的SNP calling，尤其适用于低深度测序。该方法在TCGA和千人基因组数据中验证了可靠性，并与现有先进方法比较，展现出速度和准确性优势。此外，文章还介绍了2b-RAD技术，一种高通量低成本的全基因组SNP筛查方法，适用于非模式生物。...

2012-12-17 10:10:38 179

生物信息学与数据库 版纳植物园成功研发比较基因组程序包，突破高通量测序分析瓶颈

中国科学院西双版纳热带植物园研究员Chuck Cannon与北京基因组研究所及美国得州理工大学合作，研发出可直接分析高通量短序列数据的程序包，突破传统组装瓶颈，简化比较基因组和转录组研究。该程序包通过检测kmer片段的存在与频次，无需参考基因组即可分析序列差异，并利用174个叶绿体全基因组数据验证其功能。研究成果发表于《科学公共图书馆—综合》，获中科院和云南省项目资助。...

2012-12-11 16:48:57 209

生物信息学与数据库 同济大学生物信息学系翁志萍教授课题组招聘副教授、讲师、博士后

同济大学生物信息学系翁志萍教授课题组诚聘副教授、讲师、博士后各一名。课题组主要利用生物信息学和计算生物学手段研究基因调控的遗传和表观遗传机制及小RNA沉默调控，在Cell、PNAS、Nature等期刊发表多篇论文。应聘者需具有相关博士学位和研究背景，发送材料至weng.recruit@gmail.com。...

2012-08-23 18:42:29 612

生物信息学与数据库 生物信息学：其他物种为人类生物学服务

瑞士生物信息研究所和欧洲生物信息研究所的研究表明，对人类与其他生物共有基因的研究具有重要价值，支持了同源猜想。通过分析13个物种的40万对基因，研究人员证实模式生物（如小鼠、酵母、细菌）的研究可阐明人类生物学。该成果发表于PLoS Computational Biology，并强调数据公开与生物信息基础设施建设。...

2012-05-21 16:15:55 86

生物信息学与数据库 Front.Genet：胡松年等小鼠组织新转录本鉴定研究获进展

中国科学院北京基因组研究所胡松年项目组利用二代测序和生物信息学方法，在小鼠大脑、睾丸和胚胎干细胞中鉴定出数千个新转录本，多为非编码RNA。这些转录本与转录起始信号相关，具有进化保守性，提示潜在功能。研究拓展了转录组分析思路，补充了小鼠基因组注释，为深入认识转录组组成和功能提供了新数据。...

2012-02-17 12:38:48 71

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