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《科学》:外显子组测序发现眼癌关键基因BAP1

2010-11-10 05:34 万纹 生物通 阅读 0
核心摘要: 华盛顿大学医学院利用外显子组测序技术,在葡萄膜黑色素瘤中发现BAP1基因失活性突变,该基因编码的蛋白参与泛素化调控,可能成为治疗高度转移性癌症的新靶点。研究发表于《科学》杂志,为癌症精准治疗提供了新思路。

外显子组测序示意图

来自华盛顿大学医学院的研究人员利用外显子组测序方法,找到了致命性眼癌——葡萄膜黑色素瘤的关键基因BAP1。这一研究成果可能作为未来治疗这种癌症的靶标,并用于其他具有高度转移性的癌症的治疗。该研究发表在《科学》杂志上。

领导这一研究的是华盛顿大学医学院的Anne Bowcock教授,她也是参与安徽医科大学银屑病易感基因研究的科学家之一。

葡萄膜恶性黑色素瘤是成年人中最常见的一种恶性眼内肿瘤,在国外发病率占眼内肿瘤的首位,在国内则仅次于视网膜母细胞瘤,居第二位。此瘤恶性程度高,易经血流转移,在成年人中较为多见,易与许多眼底疾病相混淆。

由于这种癌症转移程度高,找到关键基因并不容易。此前的研究发现,这种癌症涉及调节蛋白降解的基因缺陷。为了进一步分析,研究人员采用外显子组测序方法,结果在31个肿瘤样本中发现26个(占84%)在BAP1基因中存在失活性突变。

BAP1蛋白于1998年首次被发现,是易感性蛋白BRCA1的结合伙伴。BAP1蛋白可从蛋白质上清除一种叫做泛素的化学加合物,而泛素通常标记那些需要被降解的细胞蛋白。这些结果表明,BAP1信号通路不仅可作为葡萄膜黑色素瘤的治疗靶点,还有可能用于其他高度转移性癌症的治疗。

外显子组是指全部外显子区域的集合,该区域包含合成蛋白质所需的重要信息,涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异。外显子组序列捕获及第二代测序是一种新型的基因组分析技术。

与全基因组重测序相比,外显子组测序只需针对外显子区域的DNA,覆盖度深、数据准确性更高,更加简便、经济、高效。可用于寻找复杂疾病如癌症、糖尿病等的致病基因和易感基因。同时,基于大量公共数据库提供的外显子数据,科学家们能够结合现有资源更好地解释研究结果。

目前,许多科学家都利用这一方法找到了致病基因。例如,美国国家心肺血液研究所从4名弗里曼谢尔登综合征患者的DNA中准确找出了致病基因变异。研究表明,对于单个基因变异引起的疾病,外显子测序同样可以准确找到致病基因,与全基因组测序无异。研究人员认为,外显子测序也可用于多重基因变异引起的常见疾病,如糖尿病和癌症的研究中,以揭示致病基因。

(生物通:万纹)

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