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从二代到四代:基因测序技术演进与未来展望

神经组学 从二代到四代:基因测序技术演进与未来展望

本文回顾了基因测序技术从第二代到第四代的演进历程。第二代测序技术(NGS)虽大幅降低成本,但仍存在读长短、依赖PCR等局限。第四代纳米孔测序技术通过单分子电子检测,实现了超长读长、高通量和低成本,有望在数小时内完成全基因组测序,推动个体化医疗发展。文章还介绍了罗氏、Illumina等公司的布局,展望了基因测序的未来应用。...

2015-03-06 19:18:50 236
中科院基因组测序平台联盟成立

神经组学 中科院基因组测序平台联盟成立

2015年2月12日,中科院基因组测序平台联盟成立大会在北京基因组研究所召开。该联盟旨在统筹规划测序平台建设,促进技术协同与资源共享,减少仪器重复购置,提升中科院基因组研究整体能力,为精准医学和生命科学研究提供支撑。...

2015-02-16 22:10:13 163
DNA测序可揭示疾病风险:基因信息呈爆炸式增长

神经组学 DNA测序可揭示疾病风险:基因信息呈爆炸式增长

本文探讨了DNA测序技术的快速发展及其对医疗和生活的深远影响。随着测序成本急剧下降,预计到2020年人类基因组测序将变得极为便捷。基因信息可用于预测疾病风险、实现个体化用药,甚至改变择偶和职业选择方式。文章还指出,当前瓶颈在于信息科学而非生物技术本身,测序公司正迎来前所未有的机遇。...

2015-01-26 11:38:54 129

神经组学 中美科研人员成功构建大鼠转录组图谱

中美科研人员利用高通量RNA测序技术,对Fischer 344大鼠的11种器官和4个发育阶段共320个样本进行测序,构建了包含40064个基因和65167种转录物的大鼠转录组图谱。该图谱揭示了基因表达的年龄、性别和器官特异性模式,为药物毒性测试和疾病机制研究提供了重要资源。研究成果发表于《自然·通讯》。...

2014-02-17 10:01:09 191

神经组学 Science:单细胞RNA测序揭示等位基因表达的动态随机性

瑞典路德维格癌症研究所与卡罗琳斯卡学院的研究人员利用单细胞RNA测序技术,发现小鼠基因组中12-24%的等位基因只表达一个副本,且这种表达是随机动态的。这一发现挑战了传统观点,即大多数等位基因均等表达,并解释了同卵双胞胎为何存在差异,以及遗传疾病严重程度不同的原因。研究发表在《科学》杂志上。...

2014-01-14 09:06:21 155

神经组学 美完成55个埃希氏菌种基因测序,可预测其繁盛环境

美国加州大学圣地亚哥分校生物工程师通过对55个埃希氏菌种进行基因测序,重建了每个菌种的代谢目录,发现利用这些目录能预测每种菌株的繁盛环境。该成果有助于开发控制致死性埃希氏菌传染的方法,并理解菌种变毒机制。研究还识别出营养缺陷型菌种与毒性的关联,未来计划将方法扩展到其他病原菌。...

2013-11-26 16:53:28 128

神经组学 NGS调查:测序中最大的挑战是什么?

本文基于生物通开展的新一代测序技术有奖调查结果,分析了国内NGS应用现状。调查显示,科研机构是主要用户,Illumina测序仪占主导,转录组和全基因组测序最受欢迎。数据分析被69%的参与者视为最大挑战,样本制备次之。用户期望提高测序质量、降低成本并拥有更多分析工具。...

2013-11-25 10:40:13 214

神经组学 George Church:为什么不去测序?

遗传学大牛George Church在《Nature》发文,探讨为何尽管测序成本大幅下降且准确性提高,公众仍不愿进行基因组测序。他分析了人们对测序昂贵、不准确、结果无法解释的误解,并强调科学家需加强与公众的对话,以推动基因组学在精密医学中的应用。...

2013-10-12 10:34:29 97

神经组学 单分子测序改善微生物基因组组装

美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员在《Genome Biology》上发表文章,介绍单分子实时(SMRT)测序技术在微生物基因组组装中的应用。研究表明,利用单个PacBio RS测序文库,大部分已知细菌和古细菌基因组能被完整组装,成本低于1000美元。该技术有望改善微生物基因组数据库质量,推动群体规模泛基因组研究。...

2013-09-26 10:25:39 127