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神经组学 成都生物所构建易变山羊草首个转录组数据库

中国科学院成都生物研究所余懋群研究组利用高通量测序技术,首次构建了易变山羊草的转录组数据库,获得118,064条unigene,其中7,408条与禾谷孢囊线虫抗性相关。该研究为小麦抗线虫育种和功能基因组学研究提供了重要资源,成果发表于BMC Genomics。...

2012-12-17 03:40:14 82

神经组学 后基因组时代部分组学计划介绍(2):人类表观基因组计划与人类代谢组计划

本文介绍了后基因组时代的两项重要组学计划:人类表观基因组计划(HEP)和人类代谢组计划。HEP由欧洲人类表观基因组协会于2003年启动,旨在绘制DNA甲基化图谱;国际人类表观遗传学合作组织(IHEC)于2010年成立,计划标记1000个参考表观基因组。人类代谢组计划由加拿大基因委员会于2005年资助,旨在建立人类代谢组数据库(HMDB),推动代谢组学在疾病诊断和个性化医疗中的应用。文章详细阐述了这些计划的背景、目标、资金投入及科学意义。...

2012-12-10 15:55:31 164

神经组学 第七届国际基因组学大会在香港成功召开

第七届国际基因组学大会暨2012年亚太区生物信息学峰会在香港召开,300多名专家学者探讨了基因组学、生物信息学、云计算等领域的最新进展。会议涵盖了测序技术、基因组学在疾病研究、农业和环境中的应用,以及大数据管理。华大基因宣布将继续举办系列会议,促进国际合作。...

2012-12-04 09:53:56 249

神经组学 科学家完成700种海洋藻类基因组测序

美国国家基因组研究中心联合全球机构完成了700种海洋藻类的基因组测序,这是该领域规模最大的项目。测序涵盖超微浮游生物、有害藻类、共生藻及非光合微生物,有助于解析海洋微生物多样性、生态系统功能及光合作用进化。数据将免费公开,为单细胞遗传研究提供重要资源。...

2012-12-01 11:21:18 237

神经组学 后基因组时代部分组学计划介绍(1)

本文介绍了后基因组时代部分组学计划,重点阐述了人类蛋白质组计划(HPP)的背景、成立过程、研究内容和意义。文章指出,人类基因组计划完成后,蛋白质组学成为研究重点,HPP作为国际性重大计划,旨在系统鉴定和定位人体所有蛋白质,揭示其相互作用,预计耗资10亿美元,有19个国家参与。...

2012-11-30 15:54:21 273

神经组学 版纳植物园等自主开发叶绿体全基因组比较基因组程序包

中科院西双版纳热带植物园等机构自主开发了叶绿体全基因组比较基因组程序包,该程序包无需事先组装基因组,通过直接分析kmer片段实现高通量短序列数据的比较基因组和转录组研究,突破了非模式生物基因组分析瓶颈。研究基于174个叶绿体全基因组数据验证了程序包功能,相关成果发表于PLOS ONE。...

2012-11-30 11:37:08 218

神经组学 我国复杂疾病全基因组关联研究取得重大进展

本文综述了中国在全基因组关联研究(GWAS)领域取得的重大进展。中国凭借庞大的患者群体、积极参与国际基因组计划以及疾病谱的变化,在28种疾病的GWAS研究中取得显著成果,包括精神分裂症、Graves病、鼻咽癌和系统性红斑狼疮等。文章强调了中国GWAS研究对理解疾病遗传机制的重要性,并指出未来需通过精细定位和多组学整合进一步挖掘遗传信息。...

2012-11-20 14:40:22 269
<b>ENCODE计划:探索人类基因组“荒漠”中的秘密</b>

神经组学 ENCODE计划:探索人类基因组“荒漠”中的秘密

ENCODE计划是继人类基因组计划后的又一大型国际合作项目,旨在识别人类基因组中所有功能元件。研究发现80%的基因组具有生化功能,包括启动子、增强子等调控序列。该计划揭示了基因调控网络的复杂性,为理解遗传病机制提供了重要数据。文章详细介绍了ENCODE的研究方法、主要发现及对医学和进化学的意义。...

2012-11-19 14:40:21 465

神经组学 两篇《自然》技术文章介绍基因组组织研究新进展

近期两项《自然》杂志研究报道了染色体构象捕获领域的技术进展。第一篇文章描述了一种高分辨率4C-seq新型工作流程和计算通道,第二篇则报告了一种新策略,能同时消除Hi-C数据中的多个背景来源。这些技术突破为深入理解基因组三维空间组织及其在基因调控中的作用提供了有力工具。...

2012-10-10 16:59:51 203

神经组学 探索人类基因组“荒漠”中的秘密

本文深入介绍了ENCODE(DNA组成元素百科全书)项目,这是继人类基因组计划后的又一重大国际合作。项目旨在探索人类基因组中98.5%的非编码区域,发现约80%的基因组具有生化功能,包括启动子、增强子等调控元件。文章详细阐述了ENCODE的研究方法、主要发现(如转录因子结合位点、染色质结构等)及其对理解遗传病和人类进化的意义,同时讨论了大型科研联盟的管理经验与未来挑战。...

2012-09-30 17:45:03 234