高通量测序技术极大地推动了癌症免疫学研究和个体化免疫治疗的发展。该技术不仅深化了我们对癌症基因组和肿瘤发生过程中细胞内机制的理解，还通过癌症基因组分析揭示了免疫系统可靶向的抗原表位。此外，测序技术可用于实时、高灵敏度地监测免疫组库，追踪对肿瘤生长或治疗产生应答的克隆扩增和细胞群体动态。
近年来，研究发现肠道微生物与免疫系统之间存在密切联系，这为通过选择性调节肠道细菌来改善免疫疗法提供了新途径。以下两项发表于《科学》杂志的研究揭示了微生物在免疫检查点抑制剂疗效中的关键作用。
双歧杆菌增强抗PD-L1疗效
芝加哥大学的研究人员将特定双歧杆菌菌株导入黑色素瘤小鼠的消化道，显著增强了免疫系统攻击肿瘤细胞的能力，其效果与抗PD-L1抗体等检查点抑制剂相当。联合口服双歧杆菌和注射抗PD-L1抗体几乎完全抑制了肿瘤生长。研究负责人Thomas Gajewski博士指出：“我们的结果明确证实，特定肠道细菌在增强免疫细胞对黑色素瘤（可能还包括其他肿瘤）的反应中发挥了出人意料但极为重要的作用。”该研究发表于《科学》杂志（Sivan A, et al. Science. 2015;350(6264):1084-1089）。
拟杆菌属调控CTLA-4阻断疗效
Ipilimumab（一种靶向CTLA-4的FDA批准药物）通过抑制抗原激活的免疫应答发挥抗肿瘤作用。研究发现，肠道菌群中的拟杆菌属（Bacteroides）可控制Ipilimumab的抗癌效果。机体肠道菌群丰度越高，药物疗效越好。通过粪便微生物16S RNA高通量测序和qPCR，研究人员鉴定出拟杆菌属参与Ipilimumab的抗肿瘤作用，并在动物实验中验证。进一步对25名晚期黑色素瘤患者的肠道菌群分析显示，Ipilimumab治疗后患者肠道微生物群落结构各异，每种结构由不同拟杆菌属主导（Vetizou M, et al. Science. 2015;350(6264):1079-1084）。
这些发现揭示了肠道微生物在免疫检查点抑制剂疗效中的关键调节作用，为开发基于微生物组的癌症免疫治疗策略提供了科学依据。