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神经组学 NGS调查:测序中最大的挑战是什么?

本文基于生物通开展的新一代测序技术有奖调查结果,分析了国内NGS应用现状。调查显示,科研机构是主要用户,Illumina测序仪占主导,转录组和全基因组测序最受欢迎。数据分析被69%的参与者视为最大挑战,样本制备次之。用户期望提高测序质量、降低成本并拥有更多分析工具。...

2013-11-25 10:40:13 215

神经组学 George Church:为什么不去测序?

遗传学大牛George Church在《Nature》发文,探讨为何尽管测序成本大幅下降且准确性提高,公众仍不愿进行基因组测序。他分析了人们对测序昂贵、不准确、结果无法解释的误解,并强调科学家需加强与公众的对话,以推动基因组学在精密医学中的应用。...

2013-10-12 10:34:29 99

神经组学 单分子测序改善微生物基因组组装

美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员在《Genome Biology》上发表文章,介绍单分子实时(SMRT)测序技术在微生物基因组组装中的应用。研究表明,利用单个PacBio RS测序文库,大部分已知细菌和古细菌基因组能被完整组装,成本低于1000美元。该技术有望改善微生物基因组数据库质量,推动群体规模泛基因组研究。...

2013-09-26 10:25:39 128

神经组学 华大基因是如何成为测序“富士康”的?

华大基因作为全球最大的基因测序公司,被誉为生物界的“富士康”。本文深入分析了其成功的关键因素:生物技术IT化、市场需求与战略布局、技术积累与实战经验、低成本优势以及政府资金支持。通过高通量测序技术的革命性突破,华大基因实现了大规模、低成本测序,并利用人口红利和国产材料进一步降低成本。政府资金和国开行授信为其设备采购提供了保障。这些因素共同推动了华大基因成为世界测序领域的领导者。...

2013-08-05 21:30:38 107

神经组学 全球聚焦人脑研究:美国与欧盟的脑科学计划解析

本文聚焦美国“脑计划”和欧盟“人脑工程”两大项目,探讨其在神经科学领域的最新技术进展,包括神经元活动测量、新型神经探索装置以及三维人脑图谱的绘制。这些研究为解开人脑奥秘提供了重要的科学基础。...

2013-07-24 16:07:26 140

神经组学 《科学》重要论文:绘制大脑甲基化图谱

索尔克生物研究所的研究人员在《科学》杂志上发表论文,绘制了小鼠和人类大脑额叶皮质的DNA甲基化图谱,包括CG甲基化和非CG甲基化。研究发现非CG甲基化在发育过程中迅速累积,尤其在生命头两年突触形成期,且与基因低表达相关。甲基化模式在个体间及跨物种间高度保守,为理解精神疾病等神经发育异常提供了重要参考。...

2013-07-09 12:13:52 102

神经组学 RNA Biology:章张等发表长非编码RNA分类问题的综述文章

中国科学院北京基因组研究所章张研究员团队与沙特阿卜杜拉国王科技大学合作,在RNA Biology上发表综述,系统总结了长非编码RNA的分类问题。文章从基因组位置、功能、靶基因结合等角度探讨了分类方法,并指出准确分类对研究lncRNA功能具有重要意义。...

2013-06-22 13:50:57 86

神经组学 美研究者完成“生命暗物质”基因组测序

美国克雷格·文特尔研究所利用单细胞基因组捕获技术,成功完成了对“候选门TM6”细菌的基因组测序。这种被称为“生命暗物质”的细菌广泛存在于水环境中,但无法在实验室培养。测序结果显示其无法制造氨基酸,可能依赖寄生或共生生存。该研究为探索难以培养的微生物提供了新方法,有助于揭示其生态功能。...

2013-06-14 16:55:07 161

神经组学 后基因组时代部分基因组计划介绍(3):国际人类基因组单体型图(HapMap)计

本文介绍了后基因组时代的重要计划之一——国际人类基因组单体型图(HapMap)计划。文章阐述了HapMap计划的背景、目标、参与国家、两阶段战略以及主要成果。HapMap计划通过大规模SNP分型,构建了人类基因组单体型图,为全基因组关联研究(GWAS)提供了关键工具,推动了复杂疾病遗传易感位点的发现。文章还提到了计划二期在Nature上发表的高分辨率HapMap成果,准确度超过99%。...

2013-03-14 20:36:19 265